Halopanivirales
Halopanivirales ist eine Ordnung doppelsträngiger DNA-Viren, die thermophile Bakterien und halophile Archaeen infizieren.Sie enthielt zunächst nur die 2015 vom Internationalen Komitee für Taxonomie von Viren (englisch International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV) offiziell anerkannte Familie Sphaerolipoviridae. 2021 wurden diese Familie gesplittet, indem zwei Gattungen in eigene Familien innerhalb der Ordnung Halopanivirales gestellt wurden.[2][1]Die Virusteilchen (Virionen) der Viren dieser Ordnung sind ikosaedrisch, mit einem schwanzlosen Kapsid und einer internen Lipidmembran zwischen dem Kapsid aus Protein und dem doppelsträngigen DNA-Genom.Die Gesamtorganisation der Virionen der Halopanivirales ähnelt der von Viren der Familien Tectiviridae, Corticoviridae und Turriviridae (alle im Realm Varidnaviria).
| Halopanivirales | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Schemazeichnung eines Virions der Halopanivirales (Querschnitt & Seitenansicht) | ||||||||||||
| Systematik | ||||||||||||
| ||||||||||||
| Taxonomische Merkmale | ||||||||||||
| ||||||||||||
| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||
| Halopanivirales | ||||||||||||
| Links | ||||||||||||
|
Wirte
Die Mitglieder der Familien Sphaerolipoviridae (Gattung Alphasphaerolipovirus) und Simuloviridae (Gattung Yingchengvirus, alt Betasphaerolipovirus) infizieren halophile Archaeen,während die der Familie Matshushitaviridae (Gattung Hukuchivirus, alt Gammasphaerolipovirus) sich in thermophilen Bakterien replizieren.[3]
Systematik
Die Familie Sphaerolipoviridae war zunächst die einzige Familie im Reich Helvetiavirae (monotypisch) im Realm Varidnaviria. Der Realm Varidnaviria umfasst per Definition Viren mit einem vertikal gefalteten Jelly-Roll-Kapsidprotein, das Reich Helvetiavirae umfasst speziell Viren mit vertikal gefaltetem Single-Domain Jelly-Roll-Protein.[4]
Mit der Master Species List (MSL) #36 hat das ICTV in zwei weitere Familien, Matshushitaviridae und Simuloviridae bestätigt, um die verschobenen ehemaligen Gattungen aufzunehmen:
Das ICTV hat 2021 die Gattung Gammasphaerolipovirus innerhalb der Ordnung Halopanivirales (unter neuem Namen Hukuchivirus) in die neu gebildete Schwesterfamilie Matshushitaviridae verschoben; und auch die Gattung Betasphaerolipovirus (als Yingchengvirus) in die neu gebildete Schwesterfamilie Simuloviridae gestellt.In der Familie Sphaerolipoviridae verbleibt damit nur noch eine vom ICTV bestätigte Gattung.[1][5][6]
Ordnung Halopanivirales
- Familie Sphaerolipoviridae
- Gattung Alphasphaerolipovirus (früher Halosphaerovirus)[7]
- Spezies Alphasphaerolipovirus HCIV1 (früher Haloarcula hispanica icosahedral virus 2) mit
- Haloarcula californiae icosahedral virus 1; Wirt: Haloarcula hispanica
- Spezies Alphasphaerolipovirus HHIV2 (früher Haloarcula virus HCIV1) mit
- Haloarcula californiae icosahedral virus 1; Wirt: Haloarcula californiae
- Spezies Alphasphaerolipovirus PH1 (früher Haloarcula hispanica virus PH1) mit
- Haloarcula hispanica PH1 virus
- Spezies Alphasphaerolipovirus SH1 (früher Haloarcula hispanica virus SH1, ehemalige Typusspezies) mit
- Haloarcula hispanica SH1 virus
- Spezies Alphasphaerolipovirus HCIV1 (früher Haloarcula hispanica icosahedral virus 2) mit
- Gattung Alphasphaerolipovirus (früher Halosphaerovirus)[7]
- Familie Matshushitaviridae
- Gattung Hukuchivirus (früher Gammasphaerolipovirus)
- Spezies Hukuchivirus IN93 (früher Thermus aquaticus virus IN93, ehem. Typusspezies) mit
- Thermus phage IN93; Wirt Thermus aquaticus
- Spezies Hukuchivirus P2377 (früher Hukuchivirus P23-77) mit
- Thermus thermophilus virus P23-77; Wirt Thermus thermophilus
- Spezies „Thermus thermophilus virus P23-65H“[3] (ICTV-unbestätigt)
- Spezies „Thermus thermophilus virus P23-72“[3] (ICTV-unbestätigt)
- Spezies Hukuchivirus IN93 (früher Thermus aquaticus virus IN93, ehem. Typusspezies) mit
- Gattung Hukuchivirus (früher Gammasphaerolipovirus)
- Familie Simuloviridae
- Gattung Yingchengvirus (früher Betasphaerolipovirus)
- Spezies Yingchengvirus HJIV1 mit
- Haloterrigena jeotgali icosahedral virus 1
- Spezies Yingchengvirus NVIV1 mit
- Natrinema versiforme icosahedral virus 1
- Spezies Yingchengvirus SNJ1 (ehem. Typusspezies) mit
- Natrinema virus SNJ1
- Spezies Yingchengvirus HJIV1 mit
- Gattung Yingchengvirus (früher Betasphaerolipovirus)
Zum Reich Helvetiavirae gehört möglicherweise auch die Familie Portogloboviridae (derzeit noch ohne bestätigte Zuordnung zu einem Realm oder Reich). Die Viren dieser Familie scheinen jedoch mit denen der Sphaerolipoviridae aufgrund gemeinsamer primitiver Merkmale eng verwandt zu sein.[8]
SNJ1
Das temperente Haloarchaeen-Virus SNJ1 zeigt lytische und lysogene Replikationszyklen.Während des lysogenen Zyklus befindet sich das Virus in seinem Wirt Natrinema sp. J7-1 in Form eines extrachromosomalen zirkulären Plasmids. Vermöge Mitomycin C-induzierter Morphogenese (Virus-Assemblierung) können große Mengen an SNJ1-Virionen produziert werden.[9]Das SNJ1-Genom repliziert über einen Rolling-Circle-Mechanismus und wird durch das viruskodierte RepA-Protein initiiert. Dieses ist homolog zu
- den Replikationsinitiationsproteinen von archaealen Plasmiden und
- den bakteriellen Transposasen der Insertionssequenzen der IS91-Familie.
Das Virus wird dann durch Lyse der infizierten Zellen freigesetzt.[10][11]
