Peduoviridae

Die Viruspartikel (Virionen) der Peduoviridae haben den für Mitglieder der Klasse Caudoviricetes typischen Kopf-Schwanz-Aufbau.Der ikosaedrische Kopf misst etwa 60 nm. Das Kapsid zeigt eine T=7-Dextro-Symmetrie^[6] und besteht aus 72 Kapsomeren. Der Schwanz ist kontraktil (Länge etwa 135 nm, Durchmesser 18 nm) und hat 6 kurze geknickte Schwanzfasern.^[1]

Die Peduoviridae haben ein lineares dsDNA-Genom von etwa 33 bis 34 kbp (Kilobasenpaare), das für etwa 45 Proteine kodiert. Das dsDNA-Molekül hat kohäsive Enden (sticky ends oder cos sites).^[1]

Das Genom kodiert u. a. für folgende Enzyme:^[1]

• Serinprotease (Peptidase S73)
• Integrase

Die Replikation der Peduoviridae erfolgt im Zytoplasma der Wirtszellen.Sie umfasst die folgenden Schritte:^[1]

1. Adsorption: Der Phage heftet sich über seine Schwanzfasern an die Zielzelle.
2. Injektion der viralen DNA in das Zytoplasma der Wirtszelle durch Kontraktion der Schwanzscheide.
3. Transkription und Translation der „frühen“ Gene.
4. Synthese linearer Konkatamer^{[A. 1]} -Kopien der viralen DNA durch Rolling Circle.
5. Transkription und Translation der „späten“ Gene.
6. Assembly: Aufbau eines leeren Prokapsids und Verpackung des Genoms.
7. Zusammenbau der viralen Schwanzfasern und des viralen Schwanzes.
8. Die reifen Virionen werden durch Lyse (mittels Holin/Endolysin/Spanin-Proteinen^[7]) aus der Zelle freigesetzt.

Der Name der Familie Peduoviridae (bzw. ehemaligen Unterfamilie Peduoviridne) leitet sich ab von der ursprünglichen Typusart Peduovirus (alias P2likevirus) und deren Referenzstamm Escherichia-Phage P2 ab (wobei italienisch ‚duo‘ für ‚2‘ steht), versehen mit der Endung ‚-viridae‘ für Virusfamilien (bzw. ‚-virinae‘ für Virusunterfamilien).^[4][3]

Innere Systematik der Familie Peduoviridae (Stand: 3. November 2023, Spezies und Stämme^[8] nur auszugsweise):^[3]

Familie: Peduoviridae (ehemalige Myoviridae-Unterfamilie Peduovirinae^[3])^{[A. 2][2]}

• Gattung Aptresvirus
  • Spezies Aptresvirus AP3, mit
    • Burkholderia-Phage AP3
  • Spezies Aptresvirus mana, mit
    • Burkholderia-Phage Mana
• Gattung Aresaunavirus
  • Spezies Aresaunavirus RSA1, mit
    • Ralstonia-Phage RSA1
  • Spezies Aresaunavirus RsoM1USA, mit
    • Ralstonia-Phage RsoM1USA
• Gattung Arsenicumvirus
• Gattung Arsyunavirus
• Gattung Baylorvirus
  • Spezies Baylorvirus bv1127AP1, mit
    • Mannheimia-Phage vB_MhM_1127AP1
    • Mannheimia-Phage vB_MhM_587AP1
  • Spezies Baylorvirus PHL101, mit
    • Mannheimia-Phage PHL101
• Gattung Bielevirus
  • Spezies Bielevirus phiO18P, mit
    • Aeromonas-Phage phiO18P
• Gattung Bracchivirus
• Gattung Canoevirus
  • Spezies Canoevirus canoe, mit
    • Vibrio-Phage 1.202.O._10N.222.45.E8
• Gattung Catalunyavirus
• Gattung Citexvirus
  • Spezies Citexvirus BR319A
  • Spezies Pseudomonas-Virus Dobby (wiss. Citexvirus dobby, veraltet Pseudomonas virus Dobby), mit
    • Pseudomonas-Phage Dobby (engl. Pseudomonas phage Dobby, Referenzstamm)
  • Spezies Pseudomonas-Virus phiCTX (wiss. Citexvirus phiCTX, früher Pseudomonas virus phiCTX), mit
    • Pseudomonas-Phage ΦCTX alias Bacteriophage φCTX^{[A. 3][9][10][11]}
  • Spezies Citexvirus PS75V
  • Spezies: „Pseudomonas-Phage F_HA1961sp/Pa1641“ (engl. „Pseudomonas phage F_HA1961sp/Pa1641“)
  • Spezies: „Pseudomonas-Phage vB_Pae_BR319a“ (engl. „Pseudomonas phage vB_Pae_BR319a“)
• Gattung Dagavirus
  • Spezies Dagavirus ST13OXA48phi121, mit
    • Klebsiella-Phage ST13-OXA48phi12.1
• Gattung Duodecimduovirus
• Gattung Duonihilunusvirus
• Gattung Eganvirus
  • Spezies Eganvirus BIS20, mit
    • Salmonella-Phage BIS20
  • Spezies Eganvirus EtG, mit
    • Erwinia-Phage EtG
  • Spezies Eganvirus ev186, mit
    • Escherichia-Phage 186
  • Spezies Eganvirus PsP3, mit
    • Salmonella-Phage PSP3
  • Spezies Eganvirus SEN1, mit
    • Salmonella-Phage SEN1
  • Spezies Eganvirus SW9, mit
    • Salmonella-Phage SI22
    • Salmonella-Phage SW9
• Gattung Elveevirus
• Gattung Entnonagintavirus
• Gattung Evevirus
• Gattung Felsduovirus
  • Spezies Salmonella-Virus Fels2 (wiss. Felsduovirus Fels2)^[5]
    • Enterobacteria-Phage Fels-2
  • Spezies Salmonella-Phage F22 (en. „Salmonella phage F22“)^[5]
• Gattung Finvirus
• Gattung Firavirus
• Gattung Gegavirus
• Gattung Gegevirus
• Gattung Gemsvirus
• Gattung Graikaemvirus
• Gattung Hpunavirus (früher Hp1virus, Hpunalikevirus, Hp1likevirus)
  • Spezies Haemophilus-Virus HP1 (wiss. Hpunavirus HP1), mit
    • Haemophilus-Phage HP1
    • Haemophilus-Phage HP1c1
  • Spezies Haemophilus-Virus HP2 (wiss. Hpunavirus HP2), mit
    • Haemophilus-Phage HP2
  • Spezies „Escherichia-Phage ESSI2“ (engl. „Escherichia phage ESSI2“)
• Gattung Irrigatiovirus
• Gattung Irtavirus
  • Spezies Pasteurella-Virus F108 (wiss. Irtavirus F108, früher Pasteurella virus F108, mit
    • Pasteurella-Phage F108 lias Bacteriophage F108)^[12][13]
  • Spezies „Pasteurella-Phage vB_PmuM_CFP3“ (engl. „Pasteurella phage vB_PmuM_CFP3“)
• Gattung Kapieceevirus
• Gattung Kayeltresvirus
• Gattung Kisquattuordecimvirus
• Gattung Kisquinquevirus
• Gattung Longwoodvirus
• Gattung Maltschvirus
• Gattung Mersinvirus
• Gattung Nampongvirus
• Gattung Novemvirus
  • Spezies Enterobacter-Virus phiT5282H (wiss. Novemvirus T5282H), mit
    • Enterobacter-Phage phiT5282H

• Gattung Peduovirus (früher P2virus, P2likevirus, P2-ähnliche Viren)^{[A. 4][16]}
  • Spezies Peduovirus 11W
  • Spezies Peduovirus AC1
  • Spezies Peduovirus DC1
  • Spezies Peduovirus fiAA91ss
  • Spezies Peduovirus HQ103
  • Spezies Peduovirus L413C, mit
    • Yersinia-Phage L-413C
  • Spezies Escherichia-Virus magyaro (wiss. Peduovirus magyaro, früher Escherichia virus magyaro), mit
    • Escherichia-Phage P2^[17][18] (unterscheide Enterobacteria-Phage P2 und andere „P2“ benannte Phagen)^{[A. 5]}
  • Spezies Peduovirus P2
  • Spezies Escherichia-Virus P2 (wiss. Peduovirus P2, früher Escherichia virus P2), mit
    • Enterobacteria-Phage P2^[20] (Bacteriophage P2, Phage P2 – unterscheide Escherichia-Phage P2 und andere „P2“ benannte Phagen)^{[A. 5]}
  • Spezies Peduovirus P37
  • Spezies Peduovirus P22H1
  • Spezies Peduovirus P22H4
  • Spezies Peduovirus P24A7b
  • Spezies Peduovirus P24B2
  • Spezies Peduovirus P24C9
  • Spezies Peduovirus P24E6b
  • Spezies Peduovirus pro147
  • Spezies Peduovirus pro483
  • Spezies Peduovirus pv12474III
  • Spezies Peduovirus R18C
  • Spezies Peduovirus SIAC10
  • Spezies Peduovirus SIDE7
  • Spezies Peduovirus STYP1
  • Spezies Peduovirus Wphi
  • Spezies Peduovirus YPM22
  • Spezies Peduovirus YPM46
  • Spezies Peduovirus YPM50
• Gattung Phitrevirus
• Gattung Piscesmortuivirus
• Gattung Playavirus
  • Spezies Playavirus SMHB1, mit
    • Salinivibrio-Phage SMHB1
• Gattung Plazymidvirus
• Gattung Quadragintavirus
• Gattung Reginaelenavirus
• Gattung Reipivirus
• Gattung Sanguivirus
• Gattung Senquatrovirus
• Gattung Seongnamvirus
  • Spezies Seongnamvirus ESSI2, mit
    • Cronobacter-Phage ESSI-2
• Gattung Simpcentumvirus
  • Spezies Simpcentumvirus Smp131, mit
    • Stenotrophomonas-Phage Smp131
• Gattung Stockinghallvirus
• Gattung Tigrvirus
• Gattung Tresduoquattuorvirus
• Gattung Valbvirus
• Gattung Vimunumvirus
• Gattung Vulnificusvirus
• Gattung Wadgaonvirus
• Gattung Xuanwuvirus
• Gattung Yongunavirus
• Gattung Yulgyerivirus
• ohne Gattungszuweisung
  • Spezies „Pseudoalteromonas-Phage DW“ (engl. „Pseudoalteromonas phage DW“)^{[21][A. 6]}

Vorgeschlagene Mitglieder (nicht vom ICTV bestätigt, in Anführungszeichen) sind der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) entnommen (auszugsweise).^[8]

Die Wirte der Peduoviridae sind Bakterien aus verschiedenen Ordnungen der Gammaproteobacteria, darunter^{[A. 7][8]}

• Aeromonadales (Aeromonas)
• Alteromonadales (Pseudoalteromonas)
• Burkholderiales (Burkholderia, Ralstonia)
• Enterobacterales (Cronobacter, Enterobacter, Erwinia, Escherichia, Klebsiella, Salmonella, Yersinia)
• Pasteurellales (Haemophilus, Mannheimia,^[23] Pasteurella^[24])
• Vibrionales (Salinivibrio,^[25] Vibrio)
• Xanthomonadales (Stenotrophomonas^[26])