펩타이드
펩타이드(영어: peptide)는 펩타이드 결합으로 연결된 아미노산들의 짧은 사슬이다.[1][2] 펩타이드라는 용어는 "소화되다(digested)"라는 의미의 고대 그리스어 "πεπτός (peptós)", "소화하다(to digest)"라는 의미의 고대 그리스어 "πέσσειν (péssein)"에서 유래하였다. 아미노산이 20개 미만인 사슬을 올리고펩타이드라고 하며, 올리고펩타이드는 다이펩타이드, 트라이펩타이드, 테트라펩타이드를 포함한다.
폴리펩타이드(영어: polypeptide)는 보다 더 길고, 연속적이며, 가지가 없는 펩타이드 사슬이다.[3] 따라서 펩타이드는 핵산, 올리고당류, 다당류 및 기타 분자들과 함께 생물학적 중합체 및 올리고머의 광범위한 화학적 부류에 속한다.
대략 50개 이상의 아미노산을 포함하는 폴리펩타이드를 단백질이라고 한다.[3][4][5] 단백질은 생물학적 방식으로 배열된 하나 이상의 폴리펩타이드로 구성되며, 보통 조효소 및 보조 인자와 같은 리간드, 또는 다른 단백질 또는 DNA나 RNA와 같은 다른 거대분자, 또는 복잡한 거대분자 집합체와 결합한다.[6]
펩타이드에 포함된 아미노산을 잔기라고 한다. 각각의 아마이드 결합이 형성될 때 물 분자가 방출된다.[7] 고리형 펩타이드를 제외한 모든 펩타이드는 펩타이드 양쪽 말단에 각각 N-말단(아미노기)과 C-말단(카복실기) 잔기를 갖는다.
종류
많은 종류의 펩타이드들이 알려져 있다. 펩타이드들은 공급원과 기능에 따라 분류되거나 범주화되었다. 《생물학적 활성 펩타이드의 핸드북》(The Handbook of Biologically Active Peptides)에 따르면 펩타이드의 일부 부류에는 식물 펩타이드, 세균/항균 펩타이드, 균류 펩타이드, 무척추동물 펩타이드, 양서류/피부 펩타이드, 독 펩타이드, 암/항암 펩타이드, 백신 펩타이드, 면역/염증 펩타이드, 뇌 펩타이드, 내분비 펩타이드, 섭취 펩타이드, 위장 펩타이드, 심혈관 펩타이드, 신장 펩타이드, 호흡 펩타이드, 아편 펩타이드, 신경영양 펩타이드 및 혈액-뇌 펩타이드 등이 있다.[8]
일부 리보솜 펩타이드는 단백질 분해의 대상이 된다. 이러한 기능은 일반적으로 고등 생물에서 호르몬 및 신호 분자로 기능하게 한다. 일부 미생물은 마이크로신 및 박테리오신과 같은 항생제로 펩타이드를 생성한다.[9]
펩타이드는 종종 인산화, 하이드록실화, 설폰화, 팔미토일화, 글리코실화 및 이황화물 형성과 같은 번역 후 변형을 겪는다. 일반적으로 펩타이드는 선형이지만 올가미 구조도 관찰되었다.[10] 오리너구리 독에서 L-아미노산을 D-아미노산으로 라세미화하는 것과 같은 보다 더 특이한 변형도 일어난다.[11]
비리보솜 펩타이드는 리보솜이 아니라 효소에 의해 만들어진다. 일반적인 비리보솜 펩타이드는 대부분의 호기성 생물에서 항산화 방어 성분인 글루타티온이다.[12] 다른 비리보솜 펩타이드는 단세포 생물, 식물, 균류에서 가장 일반적이며, 비리보솜 펩타이드 합성효소라고 하는 모듈식 효소 복합체에 의해 합성된다.[13]
이러한 복합체는 보통 유사한 방식으로 배치되며, 생성물에 대해 다양한 화학적 변형을 수행하기 위해 다양한 모듈을 포함할 수 있다.[14] 선형의 비리보솜 펩타이드도 일반적이지만 이러한 펩타이드는 보통 고리형이고 고도로 복잡한 고리 구조를 가질 수 있다. 이러한 시스템은 지방산과 폴리케타이드를 만드는 체계와 밀접하게 관련되어 있기 때문에 혼성체 화합물이 종종 발견된다. 옥사졸 또는 싸이아졸의 존재는 보통 화합물이 이러한 방식으로 합성되었음을 나타낸다.[15]
펩톤(영어: peptone)은 동물성 우유 또는 단백질 분해에 의해 소화된 고기에서 유래한다.[16] 작은 펩타이드를 포함하는 것 외에도 결과로 생성되는 물질에는 지방, 금속, 염, 비타민 및 기타 많은 생물학적 화합물이 포함된다. 펩톤은 생장하는 세균과 곰팡이를 위한 영양 배지에 사용된다.[17]
펩타이드 단편은 공급원 단백질을 식별하거나 정량화하는 데 사용되는 단백질 단편을 나타낸다.[18] 종종 이들은 통제된 샘플에 대해 실험실에서 수행된 효소 분해의 산물이지만 자연적인 영향에 의해 분해된 법의학 또는 고생물학 샘플일 수도 있다.[19][20]
화학 합성
패밀리의 예시
이 부류의 펩타이드 패밀리는 일반적으로 호르몬 활성이 있는 리보솜 펩타이드이다. 이러한 모든 펩타이드는 세포에 의해 더 긴 "프로펩타이드(propeptide)" 또는 "전구단백질(proprotein)"로 합성되고 세포를 빠져 나가기 전에 절단된다. 이들은 신호전달 기능을 수행하는 혈류로 방출된다.
항균 펩타이드
- 마가이닌 패밀리
- 세크로핀 패밀리
- 카텔리시딘 패밀리
- 디펜신 패밀리
타키키닌 펩타이드
- P 물질
- 카시닌
- 뉴로키닌 A
- 엘레도이신
- 뉴로키닌 B
혈관작동성 장 펩타이드
- 혈관작동성 장 펩타이드 (VIP, Vasoactive Intestinal Peptide, PHM27)
- 뇌하수체 아데닐산 고리화효소 활성화 펩타이드 (PACAP, Pituitary Adenylate Cyclase Activating Peptide)
- 펩타이드 PHI 27 (Peptide PHI 27, Peptide Histidine Isoleucine 27)
- 성장호르몬 방출호르몬 1-24 (GHRH 1-24, Growth Hormone Releasing Hormone 1-24)
- 글루카곤
- 세크레틴
췌장 폴리펩타이드 관련 펩타이드
- 신경펩타이드 Y (NPY, NeuroPeptide Y)
- 펩타이드 YY (PYY, Peptide YY)
- 조류 췌장 폴리펩타이드 (APP, Avian Pancreatic Polypeptide)
- 췌장 폴리펩타이드 (PPY, Pancreatic PolYpeptide)
오피오이드 펩타이드
- 프로오피오멜라노코르틴 (POMC) 펩타이드
- 엔케팔린 펜타펩타이드
- 프로디노르핀 펩타이드
칼시토닌 펩타이드
- 칼시토닌
- 아밀린
- AGG01
자가 조립 펩타이드
기타 펩타이드
용어
길이에 따른 용어
펩타이드와 관련된 여러 용어는 길이에 대한 엄격한 정의가 없으며, 그 사용에서 중복되는 경우가 많다.
- 폴리펩타이드는 많은 아미노산들(임의의 길이)이 아마이드 결합에 의해 결합된 단일 선형 사슬이다.
- 단백질은 하나 이상의 폴리펩타이드(약 50개 이상의 아미노산들로 구성)로 구성된다.
- 올리고펩타이드는 단지 몇 개의 아미노산(2개에서 20개 사이)들로 구성된다.
아미노산의 수에 따른 용어
정의된 길이의 펩타이드는 IUPAC 숫자 접두사를 사용하여 명명한다.
- 디펩타이드는 2개의 아미노산을 가지고 있다.
- 트라이펩타이드는 3개의 아미노산을 가지고 있다.
- 테트라펩타이드는 4개의 아미노산을 가지고 있다.
- 펜타펩타이드는 5개의 아미노산을 가지고 있다.
- 헥사펩타이드는 6개의 아미노산을 가지고 있다.
- 헵타펩타이드는 7개의 아미노산을 가지고 있다.
- 옥타펩타이드는 8개의 아미노산을 가지고 있다 (예: 안지오텐신 II).
- 노나펩타이드는 9개의 아미노산을 가지고 있다 (예: 옥시토신).
- 데카펩타이드는 10개의 아미노산을 가지고 있다 (예: 생식샘자극호르몬 방출호르몬 및 안지오텐신 I).
기능에 따른 용어
- 신경펩타이드는 신경 조직과 결합하여 활성을 갖는 펩타이드이다.
- 지질펩타이드는 지질이 결합된 펩타이드이고, 펩두신은 G 단백질 연결 수용체와 상호작용을 하는 지질펩타이드이다.
- 펩타이드 호르몬은 호르몬으로 작용하는 펩타이드이다.
- 프로테오스는 단백질의 가수분해에 의해 생성되는 펩타이드의 혼합물이다. 이 용어는 다소 구식 용어이다.
- 펩타이드작동성 작용제(또는 약물)은 신체 또는 뇌의 펩타이드 시스템을 직접적으로 조절하는 기능을 하는 화학 물질이다. 예로는 신경펩타이드작동성 작용제인 오피오이드작동성 작용제가 있다.
- 세포 투과 펩타이드는 세포막을 투과할 수 있는 펩타이드이다.
같이 보기
각주
외부 링크
- 위키미디어 공용에 펩타이드 관련 미디어 분류가 있습니다.