دنا ب

الدنـا ب (بالإنجليزية: B-DNA)‏ أو الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ب هو البنية الأكثر شيوعا التي يتخذها اللولب المزدوج للدنا، اقترحت سنة 1953 بواسطة فرنسيس كريك وجيمس واتسون.[1]

بنية متحركة للدنا ب.

البنية

البنية ب يمينية الاتجاه وتمتاز بقطر يبلغ حوالي 2.37 نانومتر وبعد بين أزواج القواعد يقدر بـ 0.34 نانومتر وميلان شبه عمودي على محور اللولب المزدوج (−1,2°)، وتحوي كل دورة للولب المزدوج بين 10.4 إلى 10.5 زوج قاعدي في المحاليل، تحتوي البنية ب على ثلمين غير متساويين طول الكبير 2.2 نانومتر والصغير 1.2 نانومتر.[2]ونتيجة لذلك فإنه يمكن الوصول للقواعد النووية بشكل أكبر من الخارج في الثلم الكبير وفي العادة هذا هو المكان الذي تختار البروتينات (مثل بروتينات النسخ) أن ترتبط فيه مع سلسلة الدنا.[3]

مقارنة بين الأشكال الرئيسية الثلاث

من اليسار إلى اليمين: هيئة الدنا أ، هيئة الدنا ب وهيئة الدنا ز.
الخصائص الهيكلية لأشكال الدنا الرئيسية الثلاث للولب المزدوج[4] · [5] · [6]
خصائصدنا أدنا بدنا ز
اتجاه اللولب المزدوجيمينيمينيسار
تكرار الوحدة1 bp1 bp2 bp
زاوية دوران اللولب المزدوج لكل زوج قاعدي32,7°34,3°60°/2
عدد الأزواج القاعدية لكل دورة للولب المزدوج1110,512
السن اللولبي للولب المزدوج لكل دورة2.82 نانومتر3.32 نانومتر4.56 نانومتر
البعد بين القواعد داخل اللولب المزدوج0.26 نانومتر0.34 نانومتر0.37 نانومتر
القطر2.3 نانومتر2.0 نانومتر1.8 نانومتر
انحناء الأزواج القاعدية بالنسبة لمحور اللولب المزدوج+19°−1,2°−9°
متوسط الالتواء (propeller twist)+18°+16°
اتجاه القواعد بالنسبة للسكرعكسعكسبيريميدين : عكس
بيورين : مع
انحناء روابط ذرات السكر
(Sugar pucker)
'C3-إندو'C2 - إندوسايتوسين : 'C2 - إندو
غوانين : 'C2 - إكسو

مراجع