B-DNA

B-DNA je nejčastější druh dvoušroubovice DNA, který za normálních podmínek v buňkách zcela převažuje. Blíží se tradičnímu Watson-Crickovskému modelu dvoušroubovice. Dvoušroubovice B-DNA je pravotočivá, na jednu otáčku připadá cca 10,5 párů bází a průměr dvoušroubovice činí 2 nm.[1] Některé další helikální formy jsou ve srovnání s B-DNA zcela minoritní, ačkoliv zřejmě za určitých okolností mohou vznikat i v buňkách.

Zleva: A-DNA, B-DNA, Z-DNA
B-DNA - detail

Porovnání s A-DNA a Z-DNA

Základní číselné charakteristiky tří nejznámějších helikálních forem DNA
AtributA-DNAB-DNAZ-DNA
Točivá tendence šroubovice (chiralita)pravotočivápravotočiválevotočivá
Opakovánípo každém párupo každém párupo každých dvou párech
Otočení po každém opakování32,7°34,3°-60°/2 páry
Průměrný počet párů na jedno otočení šroubovice1110,512
Sklon páru k ose20°−1,2°-9°
Vzestup vůči ose na jeden pár2,3 Å (0,25 nm)3,32 Å (0,34 nm)3,8 Å (0,37 nm)
Vzestup vůči ose na jednu otočku28,2 Å (2,82 nm)33,2 Å (3,32 nm)45,6 Å (4,56 nm)
Průměr23 Å (2,3 nm)20 Å (2,0 nm)18 Å (1,8 nm)
Konformace nukleosiduantiantiC: anti, G: syn
Konformace ribofuranózyC3'-endoC2'-endoC: C2'-endo, G: C3'-endo

Reference

Externí odkazy