Die A-Junioren-Bundesliga 2005/06 war die dritte Saison der 2003 gegründeten A-Junioren-Bundesliga. Sie wurde wie auch die Jahre zuvor in drei Staffeln gespielt.
Am Saisonende spielten die drei Staffelsieger sowie der Vizemeister der Staffel Süd/Südwest um die deutsche Meisterschaft. Die Halbfinals wurden in Hin- und Rückspiel, das Finale in einem Spiel ausgetragen.
Die drei letztplatzierten Mannschaften der drei Staffeln stiegen in die Regionalligen ab.
Deutscher A-Juniorenmeister wurde der FC Schalke 04, der sich im Finale gegen den FC Bayern München mit 2:1 durchsetzen konnte.
Nord/Nordost
| Platz | Verein | Spiele | Tore | Punkte |
|---|---|---|---|---|
| 1. | Hertha BSC (M) | 26 | 69:32 | 56 |
| 2. | Energie Cottbus | 26 | 59:27 | 55 |
| 3. | Werder Bremen | 26 | 80:44 | 53 |
| 4. | Hannover 96 | 26 | 58:31 | 49 |
| 5. | VfL Wolfsburg | 26 | 52:36 | 43 |
| 6. | Hansa Rostock | 26 | 47:54 | 38 |
| 7. | Hamburger SV | 26 | 37:34 | 37 |
| 8. | FC Sachsen Leipzig (N) | 26 | 39:40 | 37 |
| 9. | Tennis Borussia Berlin | 26 | 39:42 | 36 |
| 10. | Tasmania Gropiusstadt | 26 | 48:47 | 33 |
| 11. | Rot-Weiß Erfurt | 26 | 42:60 | 28 |
| 12. | VfL Osnabrück (N) | 26 | 41:89 | 21 |
| 13. | FV Dresden Nord | 26 | 30:62 | 18 |
| 14. | 1. FC Union Berlin (N) | 26 | 26:57 | 11 |
Legende
| Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft | |
| Absteiger | |
| (M) | Meister der letzten Saison |
|---|---|
| (N) | Aufsteiger der letzten Saison |
Torschützenliste
| Spieler | Verein | Tore | ||
|---|---|---|---|---|
| 1. |  | Christof Neumann | Energie Cottbus | 21 |
| 2. |  | Murat Turhan | SV Tasmania Gropiusstadt 73 | 17 |
| 3. | | Timur Özgöz | Tennis Borussia Berlin | 14 |
| 4. | | Renke Pflug | Werder Bremen | 13 |
| | Caglayan Tunc | VfL Wolfsburg | 13 | |
| | Tilman Zychlinski | Hannover 96 | 13 | |
West
| Platz | Verein | Spiele | Tore | Punkte |
|---|---|---|---|---|
| 1. | FC Schalke 04 | 26 | 66:19 | 62 |
| 2. | VfL Bochum (M) | 26 | 68:23 | 55 |
| 3. | Borussia Mönchengladbach | 26 | 57:22 | 55 |
| 4. | 1. FC Köln | 26 | 54:25 | 51 |
| 5. | Borussia Dortmund | 26 | 50:38 | 46 |
| 6. | Bayer 04 Leverkusen | 26 | 60:40 | 45 |
| 7. | Bonner SC | 26 | 39:53 | 32 |
| 8. | Arminia Bielefeld | 26 | 46:43 | 30 |
| 9. | Rot-Weiss Essen | 26 | 40:40 | 30 |
| 10. | LR Ahlen | 26 | 27:53 | 25 |
| 11. | SG Wattenscheid 09 | 26 | 29:49 | 22 |
| 12. | VfL Leverkusen (N) | 26 | 26:55 | 19 |
| 13. | SC Paderborn 07 (N) | 26 | 23:67 | 18 |
| 14. | Rot-Weiß Oberhausen (N) | 26 | 24:82 | 17 |
Legende
| Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft | |
| Absteiger | |
| (M) | Meister der letzten Saison |
|---|---|
| (N) | Aufsteiger der letzten Saison |
Torschützenliste
| Spieler | Verein | Tore | ||
|---|---|---|---|---|
| 1. |  | Konstantinos Mitroglou | Borussia Mönchengladbach | 24 |
| 2. | | Fisnik Zejnullahu | VfL Bochum | 21 |
| 3. | | Abdenour Amachaibou | Borussia Dortmund | 14 |
| | Jerome Assauer | 1. FC Köln | 14 | |
| | Mesut Özil | FC Schalke 04 | 14 | |
| | Tolga Öztürk | FC Schalke 04 | 14 | |
Süd/Südwest
| Platz | Verein | Spiele | Tore | Punkte |
|---|---|---|---|---|
| 1. | SC Freiburg | 26 | 70:18 | 56 |
| 2. | FC Bayern München | 26 | 71:27 | 56 |
| 3. | VfB Stuttgart (M) | 26 | 52:29 | 51 |
| 4. | TSV 1860 München | 26 | 45:32 | 43 |
| 5. | Karlsruher SC | 26 | 45:37 | 38 |
| 6. | 1. FC Kaiserslautern | 26 | 41:37 | 37 |
| 7. | SSV Ulm 1846 | 26 | 31:36 | 37 |
| 8. | 1. FC Nürnberg | 26 | 33:28 | 36 |
| 9. | TSG 1899 Hoffenheim (N) | 26 | 41:46 | 33 |
| 10. | SpVgg Greuther Fürth | 26 | 36:41 | 33 |
| 11. | Stuttgarter Kickers | 26 | 27:48 | 32 |
| 12. | Eintracht Frankfurt | 26 | 37:44 | 27 |
| 13. | SSV Jahn Regensburg (N) | 26 | 37:63 | 26 |
| 14. | Eintracht Trier (N) | 26 | 23:103 | 6 |
Legende
| Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft | |
| Absteiger | |
| (M) | Meister der letzten Saison |
|---|---|
| (N) | Aufsteiger der letzten Saison |
Torschützenliste
| Spieler | Verein | Tore | ||
|---|---|---|---|---|
| 1. | | Patrick Mayer | VfB Stuttgart | 15 |
| | Sandro Wagner | FC Bayern München | 15 | |
| 3. | | Martin Hess | VfB Stuttgart | 14 |
| 4. | | Timo Waslikowski | SC Freiburg | 13 |
| 5. | | Felix Roth | SC Freiburg | 12 |
Endrunde um die Deutsche A-Junioren-Meisterschaft 2006
Halbfinale
| Gesamt | Hinspiel (17.6.2006) | Rückspiel (17.5.2006) | ||
|---|---|---|---|---|
| Bayern München | 3:1 | SC Freiburg | 2:1 (1:1) | 1:0 (1:0) |
| Hertha BSC | 2:3 | FC Schalke 04 | 2:0 (1:0) | 0:3 (0:1) |
Finale
Das Finale fand am 4. Juni 2006 im Gelsenkirchener Stadion Lüttinghof statt.
| Paarung |  FC Schalke 04 – .svg){kind=small} FC Bayern München |
| Ergebnis | 2:1 (2:1) |
| Datum | 4. Juni 2006 um 11:00 Uhr |
| Stadion | Stadion Lüttinghof, Gelsenkirchen |
| Zuschauer | 6528 |
| Schiedsrichter | Peter Gagelmann (Bremen) |
| Tore | 1:0 Pisano (20.) 2:0 Boenisch (34., Elfmeter) 2:1 Görlitz (45.) |
| FC Schalke 04 | Ralf Fährmann – Nedim Hasanbegović, Benedikt Höwedes, Jens Grembowietz, Sebastian Boenisch – André Kilian, Timo Kunert (84. Andreas Altenbeck), Salih Altın, Mesut Özil – Giuseppe Pisano (74. Tolga Öztürk), Tayfun Pektürk (89. Kevin Kisyna) Cheftrainer: Norbert Elgert |
| FC Bayern München | Thomas Kraft – Matthias Schwarz, Alexander Benede, Mats Hummels, Sebastian Langkamp – Tom Schütz (81. Alexander Buch), Stefan Rieß (71. Steffen Schneider), Michael Görlitz, Deniz Yılmaz – Sandro Wagner (79. Daniel Sikorski), Christian Doll (64. Marco Höferth) Cheftrainer: Kurt Niedermayer |
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