Usuario:Juan Mayordomo/Ficha

Uso

Lisozima
Estructura de la lisozima por cristalografía de rayos X del PDB
Datos generales

Parámetros

Generales

• nombre de la proteína, preferiblemente de UniProt (The Universal Protein Resource). Para enzimas se recomienda utilizar como fuente la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) (véase en IUBMB).

• otros nombres: nombres alternativos de la proteína.

• imagen de la proteína, normalmente obtenida del Banco de Datos de Proteínas (PDB). Adicionalmente pueden utilizarse los parámetros:

• pie de la imagen, normalmente especificando la estructura usada para generar la imagen, preferiblemente mediante la plantilla {{PDB2}}.
• tamañoimagen: tamaño de la imagen, por defecto 220 pixels.

• símbolo y en su caso símbolos alternativos de la proteína, usualmente en mayúsculas. Para proteínas humanas véanse los símbolos aprobados por la Organización del Genoma Humano (ver HUGO).

Identificadores

Proteínas

• HGNCid: El número entregado a la proteína en HUGO.

Enzimas

• número EC de clasificacion de enzimas desarrollado por el Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB). Véase IUBMB. Para que funcione el enlace se debe informar el parámetro número EC IUBMB con el número EC sustituyendo los puntos de separación por barras (ejemplo, 1.1.1.1 → 1/1/1/1).

• CAS_number: Número CAS, identificación numérica única para compuestos químicos, polímeros, secuencias biológicas, preparados y aleaciones.

Datos genéticos

• Cromosoma: En que cromosoma se encuentra el gen que la codifica.
• Brazo: brazo del cromosoma en que se encuentra el gen. Puede ser p o q.
• Banda: Banda en que se encuentra el gen.
• Gen: El gen oficial. En el caso de humanos, es posible obtenerlo de [www.genenames.org HUGO].
• Gen_tipo: Se seguira la clasificacion obtenida de Entrez para esta variable [1]

Gen Codificante

Pseudogen

ARNr

ARNt

ARNmisc

ARNsc

ARNsn

ARNsno

Otro

Desconocido

Estructura/Función proteíca

• Largo_proteína: La cantidad de aminoácidos que componen la proteína.
• Peso_molecular: El peso molecular de la proteína, en Daltons
• Estructura: Puedes comentar sobre su estructura, o entregar un enlace a alguna base de datos de estructura.
• Tipo: El tipo de proteína.
• Funciones:L funcion o funciones de la proteína.
• Dominio: Dominios proteicos que presenta la proteína. Mas informacion en en:Protein domains.
• Motivos: Motivos proteicos que existen en la proteína. Mas informacion en en:Structural motif
• Productos_alt: Otros productos que puedan ser generados de la transcripcion del gen.

Información adicional

• Taxón: Especies, géneros o filas que expresan la proteína.
• Célula: Las células que expresan esta proteína.
• Ubicacion: En que parte de la celula se encuentra la proteína.
• Modificacion: Las modificaciones post-traduccionales que sufre la proteína.
• Prop_biofisqcas: Datos fisico-quimicos sobre la proteína y/o su funcion.
• Ruta: Las rutas metabólicas en la que la proteína participa.
• Interacciones: Las interacciones que tiene esta proteína, con otras proteínas, organelos, ligandos, etc.

Datos enzimáticos

• Act_catalítica: La reaccion catalizada por la enzima.
• Cofactores: Si la enzima necesita de cofactores, anotarlos acá.
• Km: La Constante de Michaelis de una proteína. Revisar Cinética de Michaelis-Menten.
• Vmax:La velocidad maxima de una proteína, predicha por la cinética de Michaelis-Menten.
• Reg_enzimática: Regulación enzimática, cómo se regula la enzima.

Datos de receptor/ligando

• Acción: Descripcion de la accion del receptor.
• Agonista: Los agonistas del receptor.
• Antagonista: Los antagonistas del receptor.

Datos biotecnológicos/médicos

• Enfermedad: Enfermedades asociadas a la proteína.
• Fármaco: Farmaco relacionado con la proteína.
• Biotecnología: Los usos biotecnológicos que posea la proteína.

Bases de datos

• EntrezGene: El numero dado a la proteína en EntrezGene.
• OMIM: El código OMIM de la proteína.
• RefSeq
• UniProt
• PDB
• PDB_supplemental: Si hay mas de un PDB disponible (ocupar {{PDB2}}).
• Código
• Accesion: Numero de Entrez en la NCBI, para buscar informacion sobre la proteína.

Encimas

Información Relacionada

• Artículo: Los artículos de Wikipedia, relacionados con la proteína
• Publicación: Lista de publicaciones recientes acerca de la proteína.