Keminformaatika

Keminformaatika (tuntud ka kui kemoinformaatika) on füüsikalise keemia haru, mis tegeleb arvutiteaduse võimaldatud tehnikate ja andmevõtumeetodite (nn in silico tehnikad) rakendamisega keemilistes uuringutes, eelkõige uute ravimite väljatöötamisel.[1] Meetodeid saab kasutada ka keemiatööstuses ja sellega seotud tööstusharudes ning sellistes valdkondades nagu keskkonnateadused ja farmakoloogia, kus kasutatakse või uuritakse keemilisi protsesse.[2]

Liigendus

Andmebaaside loomine ja haldamine

Tarkvara keemiliste struktuuride andmebaasidega töötamiseks (salvestamine, väljavõtete tegemine):

  1. ISIS/Host, ISIS/Base (www.mdli.com)
  2. ChemFinder, ChemOffice (www.cambridgesoft.com)
  3. JChem (www.chemaxon.com)
  4. THOR (www.daylight.com)
  5. MOE (www.chemcomp.com)
  6. ICM Pro (mySQL) (www.molsoft.com)
  7. CheD (Сергей Трепалин)
  8. UNITY (www.tripos.com)
  9. OrChem (orchem.sourceforge.net)

Keemilist teavet sisaldavad avalikud andmebaasid:

  1. PubChem (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)
  2. ZINC (zinc.docking.org)
  3. DrugBank (www.drugbank.ca)
  4. BindingDB (www.bindingdb.org)
  5. DUD (dud.docking.org)
  6. ChemSpider (www.chemspider.com)
  7. ChEMBL (www.ebi.ac.uk)
  8. ChEBI (www.ebi.ac.uk)

Viited

Kirjandus

Välislingid