Tracheophyta

Le groupe des Tracheophyta comprend 391 000 (383 671 espèces selon Ulloa Ulloa et al. publiés dans la revue Science fin 2017^[3]) connues en 2015 (dont 369 000 espèces de plantes à fleurs), sachant que près de 2 000 nouvelles espèces sont découvertes par an^[4] (dont 744/an [moyenne sur 25 ans, donnée en 2017] rien que pour les Amériques où à la fin de 2017 étaient répertoriées 124 993 plantes vasculaires, classées en 6 227 genres et 355 familles, soit 33 % du total mondial connu^[3]).

Adaptations au milieu terrestre

Le milieu aérien impose des contraintes hydriques par rapport au milieu aquatique pour les plantes qui ont conquis les terres. Les trachéophytes présentent plusieurs traits évolutifs très adaptés à la vie terrestre, notamment l'homéohydrie (leur teneur en eau est maintenue relativement constante pendant toute leur existence^[5], quelles que soient les variations de l'état hygrométrique de l'air et de la teneur en eau du sol : cuticule cireuse et spores entourées d’une paroi imprégnée de sporopollénine qui préviennent de la déshydratation par la transpiration ; présence de racines et de vaisseaux conducteurs qui permettent la circulation de l'eau et des nutriments dans toutes les parties de la plante ; développement d'un appareil végétatif très ramifié qui permet d'échanger au maximum le dioxyde de carbone et le dioxygène avec l'air^[6].

Cycles reproductifs

Classes actuelles

Les classes (nom scientifique se terminant par -opsida) des nouvelles classifications correspondent à des rangs traditionnellement considérés comme des divisions avec une terminaison en -phyta.
Liste des classes selon l'ITIS (26 avril 2019)^[7] :

• sous-division des Lycopodiophytina
  • Lycopodiopsida - Lycophytes
• sous-division des Polypodiophytina
  • Polypodiopsida - Fougères et Prêles
• sous-division des Spermatophytina (Plantes à graines)
  • (Angiospermes)
    • Magnoliopsida - Plantes à fleurs
  • (Gymnospermes)
    • Cycadopsida (avec les Cycas)
    • Ginkgoopsida (avec le Ginkgo)
    • Gnetopsida – Gnétophytes
    • Pinopsida – Conifères.

• 
  Cycas revoluta (Cycadophyta, cycas)
• 
  Ginkgo biloba (Ginkgophyta, ginkgos)
• 
  Welwitschia mirabilis (Gnetophyta)
• 
  Selaginella flabellata (Lycopodiophyta)
• 
  Abies pinsapo (Pinophyta, conifères)
• 
  Alsophila lepifera (Pteridophyta, fougères)
• 
  Kalmia latifolia (Magnoliophyta, plantes à fleurs)
• 
  Reconstitution de Pertica quadrifaria, espèce fossile.

Groupes fossiles

Liste des groupes fossiles selon Novikov & Barabasz-Krasny (2015)^[8] :

• sous-règne Lycopodiobiotina Doweld (= Lycopodiophytina) :
  • division † Langiophytophyta Doweld
  • division † Rhyniophta Cronq., Takht. & Zimmerm.
  • division † Zosterophyllophyta H. Bold – groupe-tronc des Lycophytes
• sous-règne Pteridiobiotina Britton & Brown (= Euphyllophyta) :
  • super-division Cycadophytanae Doweld (= Spermatophytina) :
    • division † Progymnospermophyta Bold et al.
    • division † Pteridospermatophyta Meyen – « Fougères à graines ».

Ces divisions peuvent, dans les nouvelles classifications, avoir le rang de classe et une terminaison en -opsida au lieu de -phyta.

Phylogénie des Ptéridophytes actuelles d'après le Pteridophyte Phylogeny Group (2016)^[9] :

Tracheophyta         (Lycopodiophytina)  →   Lycopodiopsida    Lycopodiales  –  Lycopodes  Isoëtales      –      Isoètes  Selaginellales     –     Sélaginelles  Euphyllophytina    Polypodiopsida       Equisetidae    Equisetales    –    Prêles Ophioglossidae     Psilotales – Psilotes   Ophioglossales     Marattiidae    Marattiales   Polypodiidae    Osmundales  Hymenophyllales  Gleicheniales  Schizaeales  Salviniales  Cyatheales  Polypodiales     (Spermatophyta) les plantes à graines

Fougères

Classification phylogénétique : voir article Archaeplastida (classification phylogénétique).

Depuis plusieurs siècles les flores permettent aux botanistes d'identifier les espèces de trachéophytes qu'ils observent. Les progrès de l'histologie^[10], de la phylogénétique ^[11] la génétique puis l'apparition de l'informatique et de la bioinformatique ou encore la découverte de nouveaux biomarqueurs (cyanogènes par exemple^[12]) ont ensuite contribué à l'apparition de nouveaux moyens d'étude et d'identification^[13].

Par exemple, en France, au début de 2015^[14], la base de données BDTFX, contient un référentiel des trachéophytes de France métropolitaine et des pays voisins, et un index synonymique et nomenclatural de 95 005 noms pour 21 812 taxons. Il est issu de la BDNFF, et a été mis au point par Tela Botanica. Depuis mars 2015, il propose aussi des liens vers la diagnose du nom et renvoie vers le numéro de page correspondante de Flora Gallica.

Pour la France, une nouvelle version (12 octobre 2011) du référentiel des trachéophytes de métropole a été mise en ligne sur le site de l’INPN^[15].

En France, la Fédération des conservatoires botaniques nationaux met à disposition du grand public, sur Internet, des données de répartition sur les trachéophytes à travers un atlas national de la flore de France^[16].