M. Th. Houtsma et al. (eds.): The Encyclopædia of Islam. A Dictionary of the Geography, Ethnography and Biography of the Muhammadan Peoples. 4 vols. and Suppl., Leiden: Brill, 1913-38
De strijd over het dogma in den Islam tot op el-Ashcari. Leiden, 1875
Histoire des Seldjoucides de l'Iraq. Leiden, 1889
'Bilder aus einem Persischen Fālbuch'. In: Internationales Archiv für Ethnographie, Bd. III, 1890
De Ontwikkelingsgang der hebreeuwsche taalstudie. Utrecht, 1890
'Some Remarks on the History of the Saljuks'. In: Acta Orientalia 3 (1924)
Daniël van der Zande, Martinus Th. Houtsma, 1851-1943: een bijdrage aan de geschiedenis van de oriëntalistiek in Nederland en Europa. Proefschrift Universiteit Utrecht, 1999
Collectie Houtsma in Digitaal Repertorium Utrechtse Bijzondere Collecties