Alligatoroidea

Вважається, що надродина Alligatoroidea відокремилася від лінії крокодилів-гаріалів у пізньому крейдяному періоді, приблизно 80 мільйонів років тому, але, можливо, ще 100 мільйонів років тому на основі молекулярної філогенетики^[1][2][3]. Leidyosuchus з Альберти є найранішим відомим родом. Викопні алігатороїди були знайдені по всій Євразії, оскільки сухопутні мости через Північну Атлантику та Берингову протоку, що з'єднували Північну Америку з Євразією протягом крейдяного, палеогенового та неогенового періодів. Алігатори та каймани розділилися в Північній Америці під час раннього третинного або пізнього крейдяного періоду (приблизно від 53 мільйонів^[2] до приблизно 65 мільйонів років тому^[1]), а останні досягли Південної Америки в палеогені, до закриття Панамського перешийка у неогеновий період. Китайський алігатор відокремився від американського приблизно 33 мільйони років тому^[2] і, ймовірно, походить від лінії, яка перетнула Берингів сухопутний міст у неогені. Сучасний американський алігатор добре представлений у викопних залишках плейстоцену^[4]. Повний мітохондріальний геном алігатора був секвенований у 1990-х роках^[5]. Повний геном, опублікований у 2014 році, свідчить про те, що алігатор еволюціонував значно повільніше, ніж ссавці та птахи^[6].