生物分类学
生物分類學（英語：biotaxonomy）簡稱分類学（taxonomy），是关于生物个体的鉴定（identification）、归类（classification）和命名（nomenclature）的原理和方法的学科；此三要件间有相互依存的关系。生物分類學範圍包括：研究生物类群间的异同程度，阐明生物间的亲缘关系、演化过程和发展规律。[1]
要將生物分類，首先要知道生物與非生物的定義，但是我們似乎沒有辦法準確定義，以病毒來說，雖然可在其他生物體內寄生並複製，但在生物體外卻沒有一般生物的特徵如製造或攝取營養，生殖等現象。又如引起瘋牛病的朊粒（prion）可以造成感染卻無DNA成分，一直以來，DNA被視為生命遺傳物質，經由與RNA的轉錄轉譯過程，形成蛋白質，再進一步形成組成細胞的各個部分，如細胞膜、胞器等，而細胞則是我們長久以來所認為組成生命體的最小單位。
生物命名规范
关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（International Code of Botanical Nomenclature，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。
生物分界(kingdom)和域(domain)
传统上，生物分为五界(kingdom)，
Copeland提出过四界说：
也有人使用三域系統说。这种分类方法是依據细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。
另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。
| 卡尔·林奈 1735[2] | 恩斯特·海克尔 1866[3] | 埃德·查頓 1925[4] | 赫伯特·科普蘭 1938[5] | 罗伯特·魏泰克 1969[6] | 卡尔·乌斯 et al. 1990[7] | 湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯 1998[8] |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2 界 | 3 界 | 2域系統 | 界 (生物) | 界 (生物) | 三域系統 | 界 (生物) |
| （未論述） | 原生生物 | 原核生物 | 原核生物界 | 原核生物界 | 细菌 | 细菌 |
| 古菌 | ||||||
| 真核生物 | 原生生物 | 原生生物 | 真核生物 | 原生動物 | ||
| 色藻界 | ||||||
| 植物 | 植物 | 植物 | 植物 | 植物 | ||
| 真菌 | 真菌 | |||||
| 动物 | 动物 | 动物 | 动物 | 动物 |
分类表
生物分類總表
这个列表以NCBI Taxonomy （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的分類爲基礎。
生物詳細分類表
古菌域
包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。
細菌域
真核生物域
植物界
真菌/後生動物組
真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。
動物界
即“後生動物”組。
真菌界
其餘真核生物（原生生物和真核藻類）
- 等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
- 放射蟲綱
- 雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
- Parabasalidea
- 毛滴蟲綱（Trichomonada）
- 超鞭毛綱（Hypermastigia）
- 異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
- 眼蟲門
- 動質體目（Kinetoplastida）
- 眼蟲綱
- 隱藻綱（Cryptophyta）
- 定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
- 不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
- 囊泡蟲類
- 單孢子蟲門（Haplosporidia）
- 絲足蟲類
- 根腫菌類（Plasmodiophorida）
- 粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
- 葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
- 黏菌門
- 灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
- 紅藻門，如石花菜、紫菜。
