Coronaviridae
Coronaviridae je porodica virusa s virusnom ovojnicom ili perikapsidom i genomom kojeg čini pozitivno orijentiran jednostruki RNK lanac. Skupinu čine podskupine Letovirinae i Orthocoronavirinae. Virusi iz tih skupina napadaju vodozemce, ptice i sisavce.
| Coronaviridae | |
|---|---|
 Animacija SARS-CoV-2 Viriona | |
| Klasifikacija virusa | |
| Skupina virusa: | Riboviria |
| Carstvo: | Orthornavirae |
| Koljeno: | Pisuviricota |
| Razred: | Pisoniviricetes |
| Red: | Nidovirales |
| Podred: | Cornidovirineae |
| Porodica: | Coronaviridae |
| Rodovi[1] | |
| |
| Sinonimi | |
| Baze podataka | |
Virusni genom je duljine 26–32 kilobaze. Čestice su obično ukrašene velikim (~ 20 nm) površinskim izbočenjima u obliku latica ("peplomeri" ili "šiljci"), koji u elektronskim mikrografima sfernih čestica stvaraju sliku koja podsjeća na sunčevu koronu.
Virologija
5 'i 3' krajevi genoma imaju poklopac, odnosno poli (A) trakt. Virusna ovojnica, dobivena pucanjem kroz membrane endoplazmatskog retikuluma (ER) ili Golgijeva aparata, uvijek sadrži dvije vrste proteina specifične za virus (gliko), S i M. Glikoprotein S sadrži velike površinske izbočine, dok je M trostruka, protežu transmembranski protein. Torovirusi i odabrana podskupina koronavirusa (posebno pripadnici podskupine A u rodu Betacoronavirus) imaju, osim peplomera sastavljenih od S, drugu vrstu površinskih izbočina sastavljenih od proteina hemaglutinin-esteraze. Drugi važan strukturni protein je fosfoprotein N, koji je odgovoran za spiralnu simetriju nukleokapsida koji zatvara genomsku RNK.[4]
Taksonomija
Porodica Coronaviridae organizirana je u dvije podskupine, 5 rodova, 23 podroda i oko 40 vrsta:[5]
- Coronaviridae
- Orthocoronavirinae
- Letovirinae
- Alphaletovirus
- Milecovirus
- Microhyla letovirus 1
- Milecovirus
- Alphacoronavirus
- Colacovirus
- Coronavirus šišmiša CDPHE15
- Decacovirus
- Coronavirus šišmiša HKU10
- Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
- Duvinacovirus/ljudski coronavirus 229E
- Luchacovirus
- Lucheng Rn štakorski coronavirus
- Minacovirus
- Ferret coronavirus
- Mink coronavirus 1
- Minunacovirus
- Miniopterus coronavirus šišmiša 1
- Miniopterus coronavirus šišmiša HKU8
- Myotacovirus
- Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
- Nyctacovirus
- Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
- Pedacovirus
- Porcinski epidemijski proljevni virus
- Scotophilus coronavirus šišmiša 512
- Rhinacovirus
- Rhinolophus coronavirus šišmiša HKU2
- Setracovirus
- Ljudski coronavirus NL63
- NL63 povezan coronavirus šišmiša BtKYNL-63-9b
- Tegacovirus
- Alphacoronavirus 1
- Colacovirus
- Betacoronavirus
- Embecovirus
- Betacoronavirus 1
- Kineski Rattus coronavirus HKU24
- Ljudski coronavirus HKU1
- Mišji coronavirus
- Hibecovirus
- Betacoronavirus hp šišmiša Zhejiang2013
- Merbecovirus
- Ježev coronavirus 1
- Bliskoistočni respiratorni sindrom coronavirus (MERS-CoV)
- Pipistrellus coronavirus šišmiša HKU5
- Tylonycteris coronavirus šišmiša HKU4
- Nobecovirus
- Rousettus coronavirus šišmiša GCCDC1
- Rousettus coronavirus šišmiša HKU9
- Sarbecovirus
- SARSr-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom povezan coronavirus)
- SARS-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom coronavirus)
- SARS-CoV-2 (Teški akutni respiratorni sindrom coronavirus 2)
- SARSr-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom povezan coronavirus)
- Embecovirus
- Gammacoronavirus
- Deltacoronavirus
- Andecovirus
- Wigeon coronavirus HKU20
- Buldecovirus
- Bulbul coronavirus HKU11
- Svinjski coronavirus HKU15
- Munia coronavirus HKU13
- Coronavirus bijelog oka HKU16
- Herdecovirus
- Noćni heron coronavirus HKU19
- Moordecovirus
- Uobičajeni moorhen coronavirus HKU21
- Andecovirus
- Alphaletovirus