Discoba
A Discoba az Excavata ország alországa. Neve a Discicristata és Jakobida csoportok neveinek összevonásából ered.[1] Ezenkívül a csoport tagja a Tsukubamonada és a Heterolobosea is. A Discoba tagja továbbá a Percolozoa, melynek egyetlen ismert fertőző faja az amőbás agyhártyagyulladást okozó Naegleria fowleri.
 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||
| Rendszertani besorolás | ||||||
| ||||||
| Hivatkozások | ||||||
A Discoba testvércsoportja egyes feltételezések szerint az Ophirinina.[2]
Jellemzői
A Discoba sok gént tartalmazó mitokondriumai általában lemezes cristákkal rendelkeznek. A Pleurostomum flabellatum cristái redukálódtak, így feltehetően redukálódott vagy megszűnt képessége a sejtlégzésre. A mitokondriális genomok hosszúak, például a P. flabellatumé 57 829 bázispár.[3]
Heterolobosea
Egy Heterolobosea-faj, az Acrasis kona mtDNS-ében a többi Heterolobosea-faj génjeinek 40%-a nincs jelen, és benne többszörös nyitott leolvasási keretek találhatók.[4] Ez a DNS körkörös, GC-tartalma alacsony (16,7%).[4] Az A. kona mitokondriuma 26 ismert fehérjekódoló, 11 tRNS-gén és 10 feltételezett gén található.[4] Ez a faj továbbá képes RNS C→U módosítására is.[4] Az A. kona genomelemzése feltehetően új filogenetikai életfát tehet lehetővé, ahol az Excavata az Amorphea, a Stramenopila, Alveolata, Rhizaria és Plantae csoportokat tartalmazó Neozoa testvércsoportja.[5]
A Naegleria fowleri és a Naegleria gruberi mtDNS-ei tartalmazzák a legtöbb gént a Jakobidán kívül 42 jelzett és 4 feltételezett génnel,[4]
Egyes Heterolobosea-fajok, például a Monopylocystis- és a Pseudoharpagon-fajok sós vízben, például tengervízben élnek.[6]
Az Euplaesiobystra salpumilio esetén a sók aktív transzportja 75-100 PSU[* 1] koncentrációjú oldatban a sejtbe, 150 PSU koncentrációjúban a sejtből történik.[7] Ezenkívül legalább 4 Heterolobosea-klád nagyon vagy kizárólagosan halofil.[7]
Jakobida
A Jakobida szabadon élő heterotróf ostoros eukarióták rendje. Ezek kicsik, és aerob és anaerob környezetekben is élnek.[8][9][10] A monofiletikusnak tekintett rendben jelenleg 20 ismert faj van, és 1993-ban ismerték el rendszertani csoportként.[8][10][11]
Egy 2009-es tanulmány szerint mivel sok tenyésztetlen protisztaágat kevés, akár egy szekvencia is képviselhet, ezek igen sokrétű „ritka bioszférát” alkotnak.[12]
A Jakobida-fajok mtDNS-e általában nagyon sok gént tartalmaz, például a legtöbb fehérjét és tRNS-t kódoló gént tartalmazó mtDNS pedig az Andalucia godoyié 66 fehérjekódoló és 22 tRNS-génnel.[4]
Discicristata
A Discicristata korábban feltételezett Excavata-csoport volt, tagjai az ostoros moszatok (Euglenozoa) és a Percolozoa.[13] Nem rendelkeznek Sun fehérjékkel vagy Tpr/Mlp-homológokkal.[14]
Tsukubea
A Tsukubea osztály egyetlen ismert nemzetsége (2023) a Tsukubamonas, ennek egyetlen ismert faja a T. globosa.[15][16] Ennek mtDNS-e 48 643 bázispárból áll.[17]
Fontosságuk
A Discoba-fajok mitokondriális genomjainak megismerése fontos a mtDNS korai fejlődésének megértéséhez, mivel mtDNS-ük nagyon sok gént tartalmaz.[3]