CrRNA trans-attivatore
In biologia molecolare, il crRNA trans-attivatore (tracrRNA) è un piccolo RNA con un ruolo importante all'interno del sistema difensivo CRISPR/Cas; è, tuttavia, codificato da un gene esterno al locus CRISPR. È stato scoperto per la prima volta nel patogeno Streptococcus pyogenes.[1] Nei batteri e archea; CRISPR/Cas (acronimo dall'inglese Clustered, Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated proteins) costituisce un sistema difensivo che li protegge da invasioni virali o da plasmidi potenzialmente dannosi. Questo sistema difensivo è costituito fondamentalmente da tre fasi.
Innanzitutto una copia del DNA invasore (fagico o plasmidico) è integrato all'interno del locus CRISPR. Dopodiché, esso viene trascritto producendo il cosiddetto pre-crRNA (CRISPR RNA non maturo). Infine, l'RNA viene reclutato da Cas9 formando un complesso attivo.
Vi sono numerose vie attraverso cui questo RNA può essere attivato; una delle meglio conosciute richiede la trans-attività del tracrRNA, il quale è in grado di complementarsi parzialmente con il pre-crRNA formando un ibrido di RNA a doppio filamento. Tale ibrido non maturo è soggetto a tagli ribonucleasici mediati dalla RNasi III, una ribonucleasi RNA specifica, che genera il duplex maturo denominato ibrido crRNA/tracrRNA. Questo RNA è incorporato in un complesso effettore con la proteina endonucleasica Cas9, dove funge da RNA guida per il riconoscimento di acido nucleico estraneo, in seguito degradato da Cas9.[1][2][3][4]
