Testiranje na covid-19

• p
• p
• u

Statistika testiranja

Država ali področje	Testi	Pozitivni	Z dne	Testi / mil. ljudi	Pozitivni / 1,000 testov	Sklic
Armenija	1.580	265	25 mar	535	168	[2]
Avstralija	169,084	2,432	25 mar	6.591	14	[3]
Avstrija	32,407	5,282	25 mar	3.640	163	[4]
Bahrain	25,169	211	23 mar	16.037	8,4	[5]
Belorusija	23,000	86	25 mar	2.423	3,7	[6]
Belgija	18,360	1,486	18 mar	1.594	81	[7][8]
Bolivija	191	15	19 mar	17	79	[9]
Bosna in Hercegovina	1,133	171	25 mar	329	151	[10][11][12]
Brazilija	45,708	428	18 mar	218	9,4	[13]
Kanada	142,154	3,367	25 mar	3.751	24	[14]
Kanada: Alberta	35,089	419	25 mar	7.951	11,9	[15]
Kanada: Britanska Kolumbija	31,739	659	25 mar	6.210	21	[16]
Kanada: Manitoba	3,534	17	19 mar	2.565	4,8	[17]
Kanada: New Brunswick	1550	26	25 mar	1.987	50	[18]
Kanada: Nova Funlandija in Labrador	791	4	20 mar	1.517	5,1	[19]
Kanada: Severozahodni teritoriji	299	1	21 mar	6.659	3,3	[20]
Kanada: Nova Škotska	2,349	41	23 mar	2.403	17	[21]
Kanada: Ontario	35,635	667	25 mar	2.422	33	[22]
Kanada: PEI - Otok princa Edvarda	167	2	20 mar	1.056	12	[23]
Kanada: Quebec	27,973	1,339	25 mar	3.276	48	[24]
Kanada: Saskatchewan	3,093	26	20 mar	2.617	8,4	[25]
Kanada: Jukon	398		19 mar	9.689		[26]
Čile	7,542	922	24 mar	395	122	[27]
Kitajska: Guangdong	320,000		20 feb	2,820	1.4	[28]
Kolumbija	7,618	378	25 mar	158	50	[29]
Kostarika	1,159	113	20 mar	232	97	[30]
Hrvaška	3,159	382	24 mar	775	121	[31]
Češka	26,698	1,775	26 mar	2.507	66	[32]
Danska	19,115	2,014	26 mar	3.224	105	[33]
Ekvador	4,081	1,173	25 mar	239	287	[34]
Estonija	4,809	404	26 mar	3.620	84	[35]
Finska	10,000	626	22 mar	1.808	63	[36][37]
Francija	101,046	20,068	24 mar	1.508	199	[38]
Grenada	18	0	19 mar	162	0	[39]
Madžarska	6,817	226	25 mar	698	33	[40]
Iceland	10,658	648	24 mar	29.259	61	[41]
Indija	25,144	581	25 mar	19	23	[42]
Indonezija	3,332	790	25 mar	12,4	237	[43]
Iran	80,000	21,638	22 mar	962	270	[44]
Irska	6,636	292	17 mar	1.394	44	[45]
Israel	32,346	2,030	25 mar	3.525	63	[46]
Italija	324,445	74,386	25 mar	5.379	229	[47]
Italija:Emilia-Romagna	38,045	10,054	25 mar	8.531	264	[47]
Italija:Ligurija	6,602	2,305	25 mar	4.258	349	[47]
Italija:Lombardija	81,666	32,346	25 mar	8.117	396	[47]
Italija:Marche	7,896	2,934	25 mar	5.177	372	[47]
Italija:Piedmont	16,655	6,024	25 mar	3.823	362	[47]
Italija:Toskana	17,868	2,972	25 mar	4.791	166	[47]
Italija:Furlanija-Julijska Krajina	70,877	6,442	25 mar	14.447	91	[47]
Japonska	24,430	1,128	24 mar	194	46	[48]
Japonska:Tokio	2,087	212	24 mar	150	102	[49]
Kazahstan	5,093		13 mar	276		[50][51]
Latvija	9,796	221	25 mar	5.102	23	[52]
Litva	4,320	290	26 mar	1.546	67	[53]
Malezija	20,861	1,796	25 mar	637	86	[54]
Malta	3,391	110	24 mar	6.871	32	[55]
Mehika	2,232	367	24 mar	18	164	[56]
Nepal	687	3	25 mar	24	4,4	[57]
Nizozemska	6,000		7 mar	344		[58]
Nova Zelandija	12,683	262	26 mar	2.551	21	[59][60]
Norveška	73,089	2,566	25 mar	13.617	40	[61]
Pakistan	6,123	991	25 mar	29	162	[62]
Palestina	2,519		16 mar	499		[63]
Panama	3,690	443	25 mar	883	120	[64]
Peru	7,013	416	25 mar	214	59	[65]
Filipini	1,959	636	25 mar	19	325	[66]
Poland	26,244	957	25 mar	684	36	[67]
Portugalska	21,155	2,995	23 mar	2.059	140	[68]
Romunija	14,466	906	25 mar	746	63	[69]
Rusija	192,824	658	25 mar	1.314	3,4	[70][71]
Srbija	916	316	24 mar	132	345	[72]
Singapur	39,000	558	25 mar	6.838	14	[73]
Slovaška	4,416	216	24 mar	810	49	[74]
Slovenija	16,113	526	24 mar	7.695	33	[75]
Južna Afrika	7,425	240	21 mar	126	32	[76]
Južna Koreja	364,942	9,241	26 mar	7.058	25	[77]
Španija	355,000	24,926	21 mar	7.596	70	[78][79]
Sweden	24,500	2,510	25 mar	2.859	102	[80]
Switzerland	50,000	7,014	21 mar	5.834	140	[81]
Taiwan	27,532	235	25 mar	1.158	8,5	[82]
Tajska	13,077	934	25 mar	188	71	[83]
Turčija	33,004	2,433	25 mar	397	74	[84][85][86][87]
Ukrajina	941	113	24 mar	22	120	[88]
United Arab Emirates	125,000	140	16 mar	13.022	1,1	[89][90]
Velika Britanija	90,436	8,077	24 mar	1.339	89	[91]
ZDA (neuradni podatki)	472,820	65,497	25 mar	1.440	136	[92]
ZDA: Kalifornija	66,876	2,535	25 mar	1.693	38	[93]
ZDA: New York	103,479	30,811	25 mar	5.319	298	[94]
ZDA: Washington	33,933	2,221	23 mar	4.456	65	[95]
Urugvaj	1,538	189	24 mar	443	123	[96]
Vietnam	30,548	141	25 mar	315	4,6	[97]

Detekcija virusa

Z verižno reakcijo s polimerazo za reverzno transkripcijo v realnem času (rRT-PCR)^[98] se lahko test opravi na dihalnih vzorcih dihal, dobljenih na različne načine, tako z nazofaringealnim brisom ali iz vzorca izpljunka.^[99] Rezultati so običajno na voljo v nekaj urah do dveh dneh.^[100] Molekularne metode uporabljajo verižno reakcijo s polimerazo (PCR) skupaj s preskusi nukleinske kisline in drugimi naprednimi analitičnimi tehnikami, s katerimi se v realnem času za diagnostične namene dokaže prisotnost genetskega materiala virusa.

En prvih testov PCR so razvili v Charité vBerlinu januarja 2020; uporablja verižno reakcijo s polimerazo za povratno transkripcijo v realnem času (rRT-PCR), na njem temelji tudi 250.000 naprav, ki jih daje na voljo Svetovna zdravstvena organizacija (WHO).^[101]

Južnokorejsko podjetje Kogenebiotech je 28. januarja 2020 obvestilo javnost, da je razvilo za klinične potrebe aparat kompleta za odkrivanje SARS-CoV-2 na osnovi PCR ( PowerChek Coronavirus).^[102][103] Osredotoča se na gen "E", ki je svojski vsem beta koronavirusom, in na gen RdRp, ki je značilen za SARS-CoV-2.^[104] Druga podjetja so ravno tako javila testne pripomočke za ta namen, na primer Solgent in Seegene, ki sta februarja 2020 objavila različice kompletov za kliniko po imenu DiaPlexQ in Allplex 2019-nCoV Assay .

Na Kitajskem je bila BGI Group eno prvih podjetij, ki je od kitajske nacionalne uprave za medicinske izdelke dobilo začasno dovoljenje za komplet za odkrivanje SARS-CoV-2 na temelju PCR.^[105]

Centri za nadzor in preprečevanje bolezni v ZDA nudijo laboratorijem diagnostični test CDC 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV) na osnovi rT-PCR v realnem času^[106] Eden od treh genetskih testov v starejših različicah kompletov je zaradi okvarjenih reagentov dajal nezanesljive rezultate in zaradi tega zadrege in zamud v CDC v Atlanti; v februarju 2020 so zaradi tega dnevno lahko obdelali manj kot 100 vzorcev. Preizkusi z dvema komponentama niso bili zanesljivi, tako da je šele 28. februarja 2020 Uprava za hrano in zdravila (FDA) na osnovi zakonodaje državnim in lokalnim laboratorijem na osnovi zakonodaje za izjemne razmere dovolila.^[107] Test je odobrila.

Ameriški komercialni laboratoriji so začeli testirati v začetku marca 2020. 5. marca 2020 je LabCorp sporočil, da ima na voljo testni komplet za covid-19 na temelju RT-PCR.^[108] Quest Diagnostics je podobno javil, da bodo od 9. marca 2020 dalje po vsej državi na voljo kompletni testi za covid-19.^[109] O omejitvah glede količin niso poročali; jemanje in obdelava vzorcev morata potekati v skladu z zahtevami CDC.

V Rusiji je test za covid-19 razvil in izdelal Državni raziskovalni center za viruse in biotehnologijo VECTOR 11. februarja 2020 je test registrirala zvezna služba za nadzor v zdravstvu.^[110]

12. marca 2020 so poročali, da je klinika Mayo razvila test za odkrivanje okužbe s covidom-19.^[111]

Podjetju Roche Diagnostics je 13. marca 2020 FDA odobrila test, ki ga za rezultate potrebuje 3,5 ur, tako da en sam stroj v 24 urah obdela približno 4.128 vzorcev.^[112]

FDA je 19. marca 2020 izdala dovoljenje za uporabo v sili (EUA) podjetju Abbott Laboratories za testiranje sistema Abbott m2000; pred tem je izdala podobna dovoljenja za Hologic, LabCorp in Thermo Fisher Scientific.^[113] 21. marca 2020 je Cepheid Inc podobno od FDA prejel EUA za test, ki traja približno 45 minut.^[114]

Na Tajvanu razvijajo test, ki uporablja monoklonsko protitelo, ki se specifično veže na nukleokapsidni protein (N protein) novega koronavirusa; upajo, da bodo rezultati na voljo v 15 do 20 minutah, tako kot pri hitrem testu na gripo.^[115]

Zaznavanje protiteles

Del imunskega odziva na okužbo je tvorba protiteles, med drugim IgM in IgG. Ti proteini omogočajo odkriti okužbe pri posameznikih in preveriti ali je testirana oseba imuna..

Teste se lahko opravijo ali centralni laboratoriji (Central Laboratories Testing - CLT) ali pa na mestu samem (Point-of-Care Testing - PoCT). Avtomatizirani sistemi visoke zmogljivosti bodo v kliničnih laboratorijih zelo dobrodošli, vendar bo najprej morala steči njih proizvodnja. Za CLT se običajno uporablja en sam vzorec periferne krvi, četudi se za zasledovanje imunskega odziva lahko uporabljajo serijski vzorci. Za PoCT se običajno jemlje s punkcijo en sam vzorec krvi. Za razliko od PCR pred preizkusom ekstrakcija ni potrebna.

V ZDA bo PoCT morda na voljod o 30. marca.^[117]

9. marca 2020 so začeli razvijati krvni test za odkrivanje protiteles. Z njim bo mogoče ugotoviti, ali je bila oseba kdaj okužena, deloval bo ne glede na to, ali je oseba razvila simptome.^[118] Upati je, da na osnovi protiteles IgG in IgG mogoče dobiti rezultate v 15 minutah.^[119]

CT prsnega koša

Pregledi CT prsnega koša lahko včasih pomagajo prepoznati in opisati patologijo pljuč; pri okužbi s covidom-19 izvidi niso bili specifični. Sistematični pregled izvidov CT prsnega koša pri 919 bolnikih je značilne zgodnje znake covida-19 opisal kot "bilateralno multilobarno motnost mlečnega stekla (GGO - Ground-Glass Opacification) s periferno ali posteriorno porazdelitvijo".^[120] Ena od raziskav je pokazala, da je občutljivost CT za okužbo s covidom-19 znašala 98% v primerjavi z občutljivostjo za RT-PCR 71%; vendar gre za raziskavo v kitajski provinci Vuhan, ki je ni mogoče posplošiti.^[121] Najpogostejši izvidi CT preiskave so bili bilateralna atenuacija mlečnega stekla (neenotna ali difuzna) s subpleuralno dominanco, "crazy paving" strukturo in konsolidacijo na kasnejših stopnjah.^[122] Te ugotovitve so nespecifične in jih najdemo tudi pri drugih vrstah pljučnice in drugih bolezni pljuč.^[123] Majhna raziskava je pokazala, da so kitajski radiologi z uporabo CT slikanja ugotovili občutljivost 72-94 % in diferenciacijo covida-19 od drugih vrst virusne pljučnice 24-94 %.^[124] Natančnosti in diskriminatorne vrednosti CT testa, ki bi razlikoval COVID od drugih virusnih pljučnic doslej nobena raziskava ni potrdila. Zato CDC od 5. marca dalje CT za začetni presejalni pregled ne priporoča. Osebe s sumom na COVID je treba testirati z rT-PCR, ki je najbolj specifičen test.

• 
  Značilne slike CT
• 
  CT slika v kasnem stadiju bolezni

Hongkong je vzpostavil shemo, po kateri lahko osumljeni bolniki ostanejo doma, "urgentni oddelek bo pacientu dal cevko za vzorec", bolnik pljune vanjo in jo pošlje nazaj, čez nekaj časa dobi rezultat testa.^[125]

Britanski NHS je sporočil, da bodo začeli testirati domnevne primere doma, kar zmanjšuje tveganje za širjenje infekcije.^[126]

Pri testiranju na covid-19 s testirano osebo v avtomobilu, zdravstveni delavec skozi odprto okno vzame vzorec z ustreznimi varnostnimi ukrepi.^[127][128] Te vrste testi so Južni Koreji pomagali opraviti doslej najhitrejše in najobsežnejše testiranje katere koli države.^[129] Vprašanje je, v kolikšni meri je mogoče uspeh Južne Koreje ponoviti v drugje, v državah z manjšo gostoto prebivalstva, brez večje urbane koncentracije testiranih ose

V Nemčiji je Državno združenje zdravnikov v Obveznem zdravstvenem zavarovanju 2. marca sporočilo, da ima zmogljivost za približno 12.000 testov na dan v ambulantnem okolju, 10.700 jih je bilo storjenih teden pred tem. Stroške krije zdravstveno zavarovanje, če test naroči zdravnik.^[130] Po besedah predsednika Inštituta Roberta Kocha ima Nemčija skupno zmogljivost za 160.000 testov na teden.^[131] Od 19. marca so v večjih mestih ponudili teste iz avtomobilov.^[132]

V Izraelu so raziskovalci v bolnišnici Technion in Rambam razvili in preizkusili metodo za testiranje vzorcev anenkrat za 64 bolnikov; vzorci se združijo in nadaljnje testiranje se opravi le, če je združeni vzorec pozitiven.^{[133][134][135]}

Kitajska^[136] in ZDA^[137] sta imeli težave z zanesljivostjo testnih kompletov že v začetku izbruha, nista bili sposobni zagotoviti komplete v količinah, ki bi zadovoljile povpraševanje in priporočila za testiranje zdravstvenih strokovnjakov (o podobnih težavah poročajo tudi v Avstraliji^[138]). Strokovnjaki menijo, da je Južna Koreja s široko razpoložljivostjo testiranja uspešno omejila širjenje novega koronavirusa. Južnokorejska vlada je več let razvijala zmogljivosti za testiranje, večinoma v laboratorijih zasebnega sektorja.^[139] 16. marca je Svetovna zdravstvena organizacija obvestila javnost, da so programi za testiranje najboljši način, kako upočasniti napredovanje pandemije covida-19.^[140][141]

"Treba je testirati, to je prioriteta. Težava je v tem, da bodo države z nizkimi dohodki verjetno prišle na vrsto v tretjem valu, po Kitajski, po Evropi. Dostop do testov bo problematičen," je menil Karl Blanchet, direktor Centra za izobraževanje in raziskave v humanitarni akciji. Medtem ko so bile številne bogatejše države trenutno osredotočene na svoje prebivalstvo in gospodarstvo, bi morala humanitarna skupnost misliti na to, kako svoje sile namesto v kampanje z eno samo temo preusmeriti v krepitev svetovnih sistemov javnega zdravja.^[142]