Protein kütle spektrometrisi
Protein kütle spektrometrisi, kütle spektrometrisinin proteinlerin incelenmesine uygulanmasını ifade eder. Kütle spektrometrisi, proteinlerin doğru kütle tespiti ve karakterizasyonu için önemli bir yöntemdir ve birçok kullanımı için çeşitli yöntemler ve araçlar geliştirilmiştir. Uygulamaları arasında proteinler ve translasyon sonrası modifikasyonlarının tanımlanması, protein komplekslerinin, alt birimlerinin ve fonksiyonel etkileşimlerinin aydınlatılması veproteomikteki proteinlerin küresel ölçümü yer alır. Aynı zamanda proteinlerin çeşitli organellerdeki konumlarını belirlemek ve farklı proteinler ile membran lipidleri arasındaki etkileşimleri belirlemek için de kullanılabilir.[1][2]
Kütle spektrometresinde proteinin iyonizasyonu için kullanılan iki ana yöntem, elektrosprey iyonizasyon (ESI) ve matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyonudur (MALDI). Bu iyonizasyon teknikleri, ardışık kütle spektrometresi gibi kütle analizörleri ile birlikte kullanılır. Genel olarak, proteinler ya proteinlerin bozulmadan analiz edildiği " üst-alt " bir yaklaşımla veya proteinin ilk önce parçalara sindirildiği " alt-üst " bir yaklaşımla analiz edilir. Daha büyük peptit fragmanlarının analiz edildiği "orta-aşağı" yaklaşımı da bazen kullanılabilir.