Klub je bio funkcionalan 1997. godine pod imenom Khazar Universiteti. Osnivač kluba je bio Univerzitet Khazar. Prvobitno je igrao u amaterskim ligama. 1999. godine postaje član Premijer lige. Prvu sezoni završava na 11. mjestu. 2004. godine mijenja ime u Inter Baku PIK. Pod ovim imenom dva puta osvaja domaće prvenstvo. 2017. godine mijenja ime u Kešla FK.
U sezoni 2003/04. osvaja četvrto mjesto, to je ujedno značilo i plasman u Intertoto kup. Prvu utakmicu u evropskim takmičenjima igra 2004. godine protiv SC Bregenza, te sa ukupnih 5-1 prolazi dalje. U narednoj rundi je poražen od Tampere Uniteda.