Excavata

Giardia intestinalis

Classification WoRMS
Règne	Protozoa
Sous-règne	Eozoa

Infra-règne

Excavata
(Cavalier-Smith) Simpson, 2003

Embranchements de rang inférieur

Position phylogénétique

Eukaryota
- Unikonta
  - Amoebozoa
  - Opisthokonta
    - Holomycota
      - Nucleariida
      - Fungi
    - Holozoa
      - Mesomycetozoa
      - Filozoa
        Filasterea
        Choanobionta
        Choanomonada
        Metazoa
- Bikonta
  - Apusozoa
  - Excavata
  - Plantae
  - Chromalveolata s.l.
    - Hacrobia
      - Cryptophyta
      - Haptophyta
    - Harosa

Les Excavata (Excavés, ce qui signifie creusés) ou Excavobionta sont un infra-règne d'eucaryotes unicellulaires hétérotrophes et généralement flagellés. Le type ancestral se caractérise par la présence d'une zone creusée, le cytostome, permettant l'ingestion de fines particules alimentaires. De nombreux excavates sont anaérobies ou microaérophile et contiennent des organites particuliers et spécialisés : les mitosomes et les hydrogénosomes, ex. : Diplomonade

De nombreux Excavobiontes sont des parasites de l'homme ou d'autres animaux. ex. : Trypanosomes, Giardia

Certains possèdent des plastes (endosymbionte secondaire) et sont photosynthétiques : Euglénoides

Les excavés étaient inclus autrefois dans le règne aujourd'hui obsolète des Protista^[1].

Ils sont classifiés selon leurs structures flagellaires^[2] et ils sont considérés comme la lignèe la plus basale des flagellés^[3].

Les excavés du sous-règne des Discoba (Jakobea, Tsukubea, Euglenozoa et Percolozoa) semblent être des eucaryotes de type basal, tandis que les Neolouka (genre Malawimonas) et les Metamonada semblent maintenant être des clades frères des Podiata.

Les Discoba pourraient être hautement paraphylétiques^[4].

Les Euglenobionta et les Metamonada forment deux groupes monophylétiques.

Classification

Article détaillé : Excavata (classification phylogénétique).

En 2003 Alastair Simpson écrivait « Pour l'instant, il n'existe pas de système de taxonomie phylogénétique de haut niveau pour décrire les relations fortement étayées entre les « excavata »^[2] ». La classification ci-dessous, étant sujette à modification, n'est dont donnée qu'à titre indicatif :