Bylo založeno roku 1699 francouzským průzkumníkem Pierrem Le Moyne d'Ibervillem. Osídlení evropany začalo v roce 1721, kdy zde francouzští kolonisté založili vojenskou a obchodní stanici. V roce 1803 byla Lousiana začleněna do vzniklých Spojených států. Od roku 1893 bylo Baton Rouge označováno jako hlavní město Lousiany.
Je to jedno z nejrychleji technologicky se rozvíjejících měst na jihu USA. V roce 2021 zde zřídil Amazon a Microsoft své kanceláře nebo distribuční centra. A v roce 2023 zde založila společnost Aldi své zastoupení.[3]
V Baton Rouge je také nejvzdálenější suchozemský přístav na řece Mississippi, který je schopen obsluhovat zaoceánské tankery a nákladní lodě. Největším průmyslovým odvětvím je petrochemická výroba a zpracovatelský průmysl.
Velkoměstská aglomerace Baton Rouge je jedna z nejrychleji rostoucích (pod 1 milion obyvatel) v USA – v roce 2000 měla 600 000 a v roce 2008 už 770 000 obyvatel.
Město má rozlohu 223,56 km², z toho 199,3 km² tvoří pevnina a 5,7 km² (2,81 %) voda.
