Топологічно-асоційовані домени
Топологі́чно-асоційо́вані доме́ни, ТАД (англ. topologically associating domains, TAD) — структурні ділянки геному що перебувають у близькій просторовій взаємодії одна до одної.[1]
Топологічно-асоційовані домени було знайдено за допомогою методик Hi-C: фіксація конформації хромосоми[2] з детальним секвенуванням. Ця методика встановила, що деякі регіони ДНК в геномі людини та миші мають багато контактів між собою в межах цих регіонів, а по краям розташовані ділянки, які не контактують одна з одною. Такі ділянки, розподілені за контактним принципом, назвали топологічно-асоційованими доменами.[3]
Структура ТАД
Розміри топологічно асоційованих доменів коливаються від тисяч до мільйонів пар нуклеотидів ДНК,[4] з середньою довжиною у ~900 kb.[3] Розподілення геномної ДНК на ТАД є доволі консервативним, частково однакове в різних типах тканин, зберігається з клітиною впродовж поділів, та має певну консервативність порівнюючи мишачий та людські геноми.[3]
Вища організація ТАД включає в себе компартменти A та B типів (не плутати з компартментами клітини)[5]
