Va néixer el 19 de setembre de 1971 en una població desconeguda de la República Dominicana, filla de l'espanyol José Fernández i la cubana Silvia. És cosina de la també tennista Gigi Fernández. De ben petita es traslladà a Miami, ciutat situada a l'estat de Florida, on estudià al Carrollton School of the Sacred Heart.
El 8 d'abril del 2000 es casà amb Anthony Lewisohn Godsick, amb el qual ha tingut dos fills.
Fernández va cridar l'atenció al món del tennis per la seva sensacional carrera com a jugadora júnior, aconseguint guanyar quatre vegades consecutives el títol junior de l'Orange Bowl. El 1985, amb 14 anys i 8 dies es va convertir en la jugadora més jove en aconseguir guanyar un partit en el quadre principal de l'Open dels Estats Units, a l'aconseguir derrotar Sara Gomer en primera ronda per un 6-1 i 6-4.
El 1986 feu entrada al circuit professional, guanyant l'any 1989 el seu primer títol de dobles a Dallas, fent parella amb Betsy Nagelsen. El seu primer títol a nivell individual l'aconseguí el 1990 al torneig de Tòquio.
Obert d'Austràlia
Debutà en l'Open d'Austràlia l'any 1989, arribant a la final en categoria individual femenina l'any 1990, on fou derrotada per Steffi Graf per 6-3 i 6-4, i l'any 1992, on fou derrotada per Monica Seles per 6-2 i 6-3.
En categoria de dobles l'any 1990 arribà a la final fent parella amb Patty Fendick, si bé foren derrotades per Jana Novotná i Helena Suková. El 1991 aconseguiren guanyar el torneig en derrotar Gigí Fernández i Jana Novotná. El 1992 tornà a ser finalista del torneig, en aquesta ocasió fent parella amb Zina Garrison, però fou derrotada per Arantxa Sánchez Vicario i Helena Suková. El 1996 tornà a ser finalista, fent parella amb Lindsay Davenport, sent derrotada Chanda Rubin i Arantxa Sánchez Vicario.
Roland Garros
Debutà en el Torneig de Roland Garros l'any 1985, aconseguint arribar a la final individual femenina l'any 1993, on fou derrotada per Steffi Graf per 4-6, 6-2 i 6-4.
En la categoria de dobles aconseguí la victòria l'any 1996 fent parella amb Lindsay Davenport, derrotant a la final Gigi Fernández i Natasha Zvereva. L'any 1997 tornà a ser finalista, fent parella amb Lisa Raymond, si bé perdé davant Gigi Fernández i Natasha Zvereva.
Open dels Estats Units
En categoria individual arribà a les semifinals de la competició individual l'any 1990, on fou derrotada per Gabriela Sabatini, que finalment aconseguiria la victòria final.
Va participar, als 20 anys, en els Jocs Olímpics d'Estiu de 1992 realitzats a Barcelona (Catalunya), on aconseguí guanyar dues medalles olímpiques: la medalla d'or en la competició de dobles fent parella amb Gigí Fernández i al medalla de bronze en la competició individual. En els Jocs Olímpics d'Estiu de 1996 realitzats a Atlanta (Estats Units) aconseguí revalidar el títol de dobles juntament amb Gigí Fernández, i finalitzà quarta en la competició individual en perdre davant Jana Novotná per la lluita per la medalla de bronze.
.svg){kind=small}
