シトクロムb₆f複合体

シトクロムb₆f複合体は二量体であり、各単量体は8つのサブユニットから構成される^[3]。c型シトクロム（英語版）であるシトクロムf（英語版）（32 kDa）、低電位と高電位の2分子のヘムを結合するシトクロムb₆（25 kDa）、[2Fe-2S]型鉄硫黄クラスターを有するリスケタンパク質（英語版）（19 kDa）、そしてサブユニットIV（17 kDa）という4つの大きなサブユニットに加えて、PetG、PetL、PetM、PetNという4つの小さなサブユニット（3-4 kDa）が含まれる^[3][4]。二量体全体では、217 kDaの大きさになる。

シトクロムb₆f複合体の結晶構造は、クラミドモナスChlamydomonas reinhardtii、イデユアイミドリMastigocladus laminosus、シアノバクテリアNostoc sp. PCC 7120由来のものが決定されている^{[2][5][6][7][8][9]}。

シトクロムb₆f複合体のコア構造はシトクロムbc₁複合体のコアと類似している。シトクロムb₆とサブユニットIVはシトクロムbと相同であり^[10]、両複合体のリスケ鉄硫黄タンパク質も相同である^[11]。一方、シトクロムfとシトクロムc₁（英語版）は相同ではない^[12]。

シトクロムb₆f複合体には7つの補欠分子族が含まれている^[13][14]。そのうち4つはシトクロムb₆f複合体とシトクロムbc₁複合体で共通しており、ヘムcがシトクロムc₁とシトクロムfに、2つのヘムbがシトクロムbとシトクロムb₆に、[2Fe-2S]クラスターがリスケタンパク質に含まれている。シトクロムb₆f複合体に固有の3つの補欠分子族は、クロロフィルa、β-カロテン、ヘムc_n（ヘムx）である^[5]。

シトクロムb₆f複合体のコア内部の各単量体間の空間は脂質で埋まっており、タンパク質内の誘電環境を調節することでヘム-ヘム間の電子伝達に方向性をもたらしている^[15]。

光合成においてシトクロムb₆f複合体は、2つの光合成反応中心複合体である光化学系IIと光化学系Iの間の電子とエネルギーの伝達を媒介する機能を果たす。この過程で、葉緑体のストロマから内腔へプロトンがチラコイド膜を越えて輸送される^[2]。シトクロムb₆f複合体を介した電子伝達はプロトン勾配の形成を担い、葉緑体でのATP合成を駆動する^[4]。

還元型フェレドキシンからNADP⁺への電子伝達ができない場合、シトクロムb₆f複合体は循環的光リン酸化（cyclic photophosphorylation）に中心的役割を果たす^[16]。このサイクルはP700⁺（英語版）のエネルギーによって駆動され、ATP合成を駆動するプロトン勾配の形成に寄与する。このサイクルは光合成に必要不可欠であることが示されており^[17]、炭素固定のための適切なATP/NADPH生成比の維持を補助している^[18][19]。

シトクロムb₆f複合体内のpサイド（内腔側）キノール脱プロトン化-酸化反応は、活性酸素種の産生に関与していることが示唆されている^[20]。キノール酸化部位に位置するクロロフィル分子は活性酸素種の形成率を高める、非光化学的な構造的機能を果たしていることが示唆されており、おそらく細胞内の酸化還元シグナル伝達と関連している^[21]。

シトクロムb₆f複合体は、2つの可動性酸化還元キャリア、プラストキノール（QH₂）とプラストシアニン（Pc）の間の非循環的電子伝達(1)と循環的電子伝達(2)を担う。

シトクロムb₆f複合体は、QH₂からPcへの電子伝達を媒介し、その間に2つのプロトンをストロマからチラコイド内腔へくみ出す。反応は次のようにまとめられる。

QH₂ + 2Pc(Cu²⁺) + 2H⁺ (stroma) → Q + 2Pc(Cu⁺) + 4H⁺ (lumen)^[16]

この反応は複合体IIIと同じくQサイクル（英語版）によって行われる^[22]。QH₂は電子キャリアとして機能し、電子分岐（英語版）と呼ばれる過程で2つの電子をhigh-potential electron transport chain（ETC）とlow-potential ETCへ伝達する^[23]。複合体では最大3つのQH₂分子が電子伝達ネットワークを形成しており、光合成におけるQサイクルの作動、酸化還元センサー、触媒機能を担っている^[24]。

Qサイクル

^[22][23]

前半

1. QH₂が複合体のpサイド（内腔側）に結合する。high-potential ETCの鉄硫黄中心によってセミキノン（SQ）へと酸化され、チラコイド内腔へ2つのプロトンが放出される。
2. 還元された鉄硫黄中心は、シトクロムfを介して電子をPcへ伝達する。
3. Low-potential ETCでは、SQが電子をシトクロムb₆のヘムb_pへ伝達する。
4. ヘムb_pが電子をヘムb_nへ伝達する。
5. ヘムb_nの1電子がプラストキノン（Q）を還元し、SQが形成される。

後半

1. 2つ目のQH₂が複合体に形成する。
2. High-potential ETCでは、1電子によって他の酸化型Pcが還元される。
3. Low-potential ETCでは、ヘムb_nの電子がSQへ伝達され、完全に還元されたQ²⁻がストロマから2つのプロトンを取り込むことでQH₂が形成される。
4. 再生された酸化型Qと還元型QH₂は膜中へ拡散する。

循環的電子伝達

複合体IIIとは異なり、シトクロムb₆f複合体は循環的光リン酸化の中心となる、別の電子伝達反応も触媒する。フェレドキシン（Fd）由来の電子はプラストキノンへ伝達され、その後シトクロムb₆f複合体でプラストシアニンの還元に利用される。プラストシアニンは光化学系I中のP700によって再び酸化される^[25]。フェレドキシンによるプラストキノンの還元の正確な機構に関しては現在研究が行われている。提唱されている1つの機構は、フェレドキシン:プラストキノンレダクターゼもしくはNADPデヒドロゲナーゼが存在するというものである^[25]。ヘムxはQサイクルには必要ではないと考えられており、また複合体IIIにも存在しない。そのため、ヘムxは以下の機構で循環的光リン酸化に利用されていると提唱されている^[23][26]。

1. Fd (red) + heme x (ox) → Fd (ox) + heme x (red)
2. heme x (red) + Fd (red) + Q + 2H⁺ → heme x (ox) + Fd (ox) + QH₂

• 光化学反応
• 光化学系I
• 光化学系II
• ATP合成酵素

• 1Q90 - PDB structure of cytochrome b₆f complex from Chlamydomonas reinhardtii
• 1VF5 - PDB structure of cytochrome b₆f complex from Mastigocladus laminosus
• Cytochrome b₆f page @ Purdue University, USA
• UMich Orientation of Proteins in Membranes families/superfamily-3 - Calculated positions of b6f and related complexes in membranes
• Cytochrome b6f Complex - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）
• Plastoquinol-plastocyanin reductase - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）