ผับเคม
PubChem เป็นฐานข้อมูลของโมเลกุลเคมี ระบบนี้ถูกดูแลรักษาโดยศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (National Center for Biotechnology Information-NCBI) ซึ่งเป็นของสถาบันสุขภาพแห่งชาติ (National Institutes of Health-NIH) ของประเทศสหรัฐอเมริกา PubChem ให้บริการฟรีโดยผ่านเว็บยูสเวอร์อินเตอร์เฟซ (web user interface) PubChem จะมีข้อมูลส่วนใหญ่ของโมเลกุลขนาดเล็กซึ่งมีน้ำหนักโมเลกุลต่ำกว่า 500 สมาคมเคมีอเมริกัน (American Chemical Society) พยายามขอร้องให้รัฐสภาอเมริกันจำกัดการปฏิบัติงานของ PubChem เพราะไปก้าวก่ายงานบริการบทคัดย่อทางเคมี (Chemical Abstracts Service) ของสมาคม[1]
ฐานข้อมูล
PubChem ประกอบด้วย 3 ฐานข้อมูลขั้นพื้นฐาน:
- สารประกอบ (Compounds) 5.2 ล้านข้อมูล ประกอบด้วยสารประกอบเคมีบริสุทธิ์และสารประกอบเฉพาะ
- สสาร (Substances) 7.7 ล้านข้อมูล ประกอบด้วย ของผสมสารสกัด (extract) สารประกอบเชิงซ้อน (complexes) และสารประกอบทั่วไป
- รายงานการวิเคราะห์ทางชีวภาพ (BioAssay) กิจกรรมทางชีวภาพ (bioactivity) ที่เป็นผลจาก 176 โปรแกรม
ขอบเขตฐานข้อมูล
Identification numbers | ||
| • | Identification number in current database | [UID] |
| • | Substance identification number | [SID] |
| • | Compound identification number | [CID] |
| • | BioAssay identification number | [BAID], [AID] |
General | ||
| • | Any database field | [ALL] |
| • | Comment | [CMT] |
| • | Deposition date | [DDAT], [DEPDAT] |
| • | Depositor's external ID | [SRID], [SRCID] |
| • | Source name | [SRC], [SRCNAM], [SRCNAME] |
| • | Source release date | [SRD], [SRDAT], [RLSDAT] |
| • | Medical Subject Heading (MeSH) term | [MSHT], [MESHT] |
| • | MeSH tree node | [MSHN], [MESHTN] |
| • | MeSH pharmacological actions | [PHMA], [PHARMA] |
Substance properties | ||
| • | Substance synonyms | [SYNO] |
| • | IUPAC name | [UPAC], [IUPAC] |
| • | International Chemical Identifier (InChI) | [INCHI] |
| • | Molecular weight | [MW], [MWT], [MOLWT] |
| • | Chemical elements | [ELMT], [EL] |
| • | Non-Hydrogen atoms | [HAC], [HACNT] |
| • | Isotope count | [IAC], [IACNT] |
| • | Total formal charge | [TFC], [CHG], [CHRG] |
| • | Chiral atom count | [ACC], [ACCNT] |
| • | Defined chiral atom count | [ACDC], [ACDCNT] |
| • | Undefined chiral atom count | [ACUC], [ACUCNT] |
| • | Hydrogen bond acceptor count | [HBAC], [HBACNT] |
| • | Hydrogen bond donor count | [HBDC], [HBDCNT] |
| • | Tautomer count | [TC], [TCNT], [TTMC] |
| • | Rotatable bond count | [RBC], [RBCNT] |
| • | XLogP | [XLGP], [LOGP] |
Compound properties | ||
| • | Compound synonyms | [CSYN], [CSYNO] |
| • | Component count | [CC], [CCNT] |
| • | Covalent unit (molecule) count | [CUC], [CUCNT] |
| • | Total bioactivity count | [TAC] |