Мікробіом

Мікробіом (з дав.-гр. μικρός (βίος (bíos) «life») — спільнота мікроорганізмів, які зазвичай живуть разом у якомусь середовищі існування. Синоніми — мікрофлора, мікробіота. До можливих представників екосистеми мікробіому відносять бактерії, археї, гриби, водорості, дрібні найпростіші, бактеріофаги, віруси, плазміди та їхній відокремлений генетичний матеріал.

Морські тварини та пов'язані з ними мікробіоми
Морські тварини та пов'язані з ними мікробіоми

Важливою є роль, яку відіграють вторинні метаболіти в опосередкуванні складних міжвидових взаємодій мікроорганізмів в мікробіомі. Відчуття кворуму, викликане вторинними метаболітами, дозволяє бактеріям контролювати спільну діяльність і адаптує їхні фенотипи до біотичного середовища, що призводить, наприклад, до адгезії між клітинами або утворення біоплівки.

Етимологія та термінологія

Слово мікробіом походить від лат. micro, що означає «маленький» і лат. bíos, що означає «життя»).

Одне з перших визначень терміну вперше запропоновано JL Mohr у 1952 році в The Scientific Monthly для позначення мікроорганізмів, знайдених у певному середовищі.[1][2]

У 1988 році було запропоновано визначення терміну «певне мікробне співтовариство, що займає досить чітко визначене середовище проживання, яке має відмінні фізико-хімічні властивості»[3]в.

У 2020 році міжнародна група експертів опублікувала результати своїх дискусій[4] щодо визначення мікробіому. Вони запропонували визначення мікробіому, засноване на відродженні «компактного, чіткого та вичерпного опису терміну», 1988 року, але доповнений двома пояснювальними абзацами. Перший пояснювальний абзац висловлює динамічний характер мікробіому, а другий пояснювальний параграф чітко відокремлює термін мікробіота від терміна мікробіом .

Мікробіом і мікробіота

Ці терміни часто використовуються як синоніми. Але вони мають дещо інші тлумачення.

Мікробіом — сукупність усіх мікроорганізмів та їхніх генів у певному середовищі (частіше, у всьому організмі). Мікробіота — це сукупність тільки мікроорганізмів (без генів) у певному середовищі (флора кишечника, мікробіота шкіри).

Див. також

Примітки

Література

Книги

  • Follow your gut: the enormous impact of tiny microbes. / Knight, Rob, 2015. — Simon & Schuster. ISBN 978-1-4423-7588-8.

Журнали

Відео