Ang lungsod ay nilikha noong 1250 ni Konde Bernardino ng Cunio pagkatapos ng baha na sumira sa kaniyang kastilyo sa Donigallia. Matapos ang ilang mga sipi ng ari-arian sa mga kamay ng mga lokal na maharlikang pamilya, ang kastilyo ng Fusignano ay inilipat sa pamilya Este noong 1445.
Ang simbahan ng San Giovanni Battista ay naglalaman ng isang ika-16 na siglong maputla na naglalarawan ng Bautismo ni Kristo. Sa simbahan ng San Savino, makikita ang sinaunang sepulkro ng pangalang santo, isa sa mga unang ebanghelisador ng Romaña: gayunpaman, ang mga labi na nilalaman nito ay inilipat ni Astorre II Manfredi sa isang kapilya sa Katedral ng Faenza.
Ang Fusignano ay nagkaroon ng isang malakas na tradisyon ng kooperatiba. Sa simula ng ikadalawampu siglo mayroong dalawang malalaking kooperatiba: ang sosyalista ("ang pula") at ang republikano ("ang dilaw"). Nabuwag sila ng mga pasistang iskuwad. Sa Kalayaan nagkaroon ng tunay na lagnat ng kooperatiba: maging ang mga barbero, ang mga karpintero ay sumali sa isang kooperatiba.