TRPS1

TRPS1
Ідентифікатори
Символи	TRPS1, GC79, LGCR, transcriptional repressor GATA binding 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604386 MGI: 1927616 HomoloGene: 8556 GeneCards: TRPS1
Пов'язані генетичні захворювання
	великий депресивний розлад, unipolar depression, trichorhinophalangeal syndrome type II, trichorhinophalangeal syndrome type I
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • zinc ion binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • protein domain specific binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• skeletal system development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • NLS-bearing protein import into nucleus; • regulation of chondrocyte differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • protein heterooligomerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7227
	83925
	ENSG00000104447
	ENSMUSG00000038679
	Q9UHF7
	Q925H1
	NM_001282902; NM_001282903; NM_014112; NM_001330599
	NM_032000; NM_001310481; NM_001310485
	NP_001269831; NP_001269832; NP_001317528; NP_054831
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPS1 (англ. Transcriptional repressor GATA binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 281 амінокислот, а молекулярна маса — 141 521^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRKKNPPLR	NVASEGEGQI	LEPIGTESKV	SGKNKEFSAD	QMSENTDQSD
AAELNHKEEH	SLHVQDPSSS	SKKDLKSAVL	SEKAGFNYES	PSKGGNFPSF
PHDEVTDRNM	LAFSSPAAGG	VCEPLKSPQR	AEADDPQDMA	CTPSGDSLET
KEDQKMSPKA	TEETGQAQSG	QANCQGLSPV	SVASKNPQVP	SDGGVRLNKS
KTDLLVNDNP	DPAPLSPELQ	DFKCNICGYG	YYGNDPTDLI	KHFRKYHLGL
HNRTRQDAEL	DSKILALHNM	VQFSHSKDFQ	KVNRSVFSGV	LQDINSSRPV
LLNGTYDVQV	TSGGTFIGIG	RKTPDCQGNT	KYFRCKFCNF	TYMGNSSTEL
EQHFLQTHPN	KIKASLPSSE	VAKPSEKNSN	KSIPALQSSD	SGDLGKWQDK
ITVKAGDDTP	VGYSVPIKPL	DSSRQNGTEA	TSYYWCKFCS	FSCESSSSLK
LLEHYGKQHG	AVQSGGLNPE	LNDKLSRGSV	INQNDLAKSS	EGETMTKTDK
SSSGAKKKDF	SSKGAEDNMV	TSYNCQFCDF	RYSKSHGPDV	IVVGPLLRHY
QQLHNIHKCT	IKHCPFCPRG	LCSPEKHLGE	ITYPFACRKS	NCSHCALLLL
HLSPGAAGSS	RVKHQCHQCS	FTTPDVDVLL	FHYESVHESQ	ASDVKQEANH
LQGSDGQQSV	KESKEHSCTK	CDFITQVEEE	ISRHYRRAHS	CYKCRQCSFT
AADTQSLLEH	FNTVHCQEQD	ITTANGEEDG	HAISTIKEEP	KIDFRVYNLL
TPDSKMGEPV	SESVVKREKL	EEKDGLKEKV	WTESSSDDLR	NVTWRGADIL
RGSPSYTQAS	LGLLTPVSGT	QEQTKTLRDS	PNVEAAHLAR	PIYGLAVETK
GFLQGAPAGG	EKSGALPQQY	PASGENKSKD	ESQSLLRRRR	GSGVFCANCL
TTKTSLWRKN	ANGGYVCNAC	GLYQKLHSTP	RPLNIIKQNN	GEQIIRRRTR
KRLNPEALQA	EQLNKQQRGS	NEEQVNGSPL	ERRSEDHLTE	SHQREIPLPS
LSKYEAQGSL	TKSHSAQQPV	LVSQTLDIHK	RMQPLHIQIK	SPQESTGDPG
NSSSVSEGKG	SSERGSPIEK	YMRPAKHPNY	SPPGSPIEKY	QYPLFGLPFV
HNDFQSEADW	LRFWSKYKLS	VPGNPHYLSH	VPGLPNPCQN	YVPYPTFNLP
PHFSAVGSDN	DIPLDLAIKH	SRPGPTANGA	SKEKTKAPPN	VKNEGPLNVV
KTEKVDRSTQ	DELSTKCVHC	GIVFLDEVMY	ALHMSCHGDS	GPFQCSICQH
LCTDKYDFTT	HIQRGLHRNN	AQVEKNGKPK	E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан
Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[4]

[5]

[1]

[2]

[3]