SLC22A5

SLC22A5 je membranski transportni protein pridružen primarnom nedostatku karnitina. To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SLC22A5 sa hromosoma 5.Ovaj protein je uključen u aktivno ćelijsko preuzimanje karnitina. Djeluje kao simporter, pomičući natrijeve ione i druge organske katikone preko membrane, zajedno s karnitinom. Takvi polispecifični organski kationski transporteri u jetri, bubrezima, crijevima i drugim organima kritični su za uklanjanje mnogih endogenih malih organskih kationa, kao i širokog spektra lijekova i toksina iz okoliša.[5] Mutacije u genu SLC22A5 uzrokuju sistemski primarni nedostatak karnitina, što može dovesti do zatajenja srca.[6]

SLC22A5
Identifikatori
AliasiSLC22A5
Vanjski ID-jeviOMIM: 603377 MGI: 1329012 HomoloGene: 68295 GeneCards: SLC22A5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za SLC22A5
Genomska lokacija za SLC22A5
Bend5q31.1Početak132,369,710 bp[1]
Kraj132,395,613 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za SLC22A5
Genomska lokacija za SLC22A5
Bend11 B1.3|11 32.02 cMPočetak53,755,368 bp[2]
Kraj53,782,486 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
PDZ domain binding
GO:0022891 transmembrane transporter activity
transporter activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
quaternary ammonium group transmembrane transporter activity
symporter activity
ATP binding
GO:0015238 xenobiotic transmembrane transporter activity
organic anion transmembrane transporter activity
carnitine transmembrane transporter activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
membrana
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
brush border membrane
apical plasma membrane
Egzosom
Biološki proces sodium ion transport
quaternary ammonium group transport
ion transport
sodium-dependent organic cation transport
positive regulation of intestinal epithelial structure maintenance
carnitine transport
carnitine metabolic process
xenobiotic transmembrane transport
transmembrane transport
organic anion transport
carnitine transmembrane transport
GO:0015915 transport
xenobiotic transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001308122
NM_003060

NM_011396
NM_001362711
NM_001362712

RefSeq (bjelančevina)

NP_001295051
NP_003051

NP_035526
NP_001349640
NP_001349641

Lokacija (UCSC)Chr 5: 132.37 – 132.4 MbChr 11: 53.76 – 53.78 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 557 aminokiselina, а molekulska težina 62.752 Da.[7]

1020304050
MRDYDEVTAFLGEWGPFQRLIFFLLSASIIPNGFTGLSSVFLIATPEHRC
RVPDAANLSSAWRNHTVPLRLRDGREVPHSCRRYRLATIANFSALGLEPG
RDVDLGQLEQESCLDGWEFSQDVYLSTIVTEWNLVCEDDWKAPLTISLFF
VGVLLGSFISGQLSDRFGRKNVLFVTMGMQTGFSFLQIFSKNFEMFVVLF
VLVGMGQISNYVAAFVLGTEILGKSVRIIFSTLGVCIFYAFGYMVLPLFA
YFIRDWRMLLVALTMPGVLCVALWWFIPESPRWLISQGRFEEAEVIIRKA
AKANGIVVPSTIFDPSELQDLSSKKQQSHNILDLLRTWNIRMVTIMSIML
WMTISVGYFGLSLDTPNLHGDIFVNCFLSAMVEVPAYVLAWLLLQYLPRR
YSMATALFLGGSVLLFMQLVPPDLYYLATVLVMVGKFGVTAAFSMVYVYT
AELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTI
LTAILTLFLPESFGTPLPDTIDQMLRVKGMKHRKTPSHTRMLKDGQERPT
ILKSTAF

Struktura

Gen SLC22A5 ima 10 egzona,[8] nalazi se na q kraku hromosoma 5 u poziciji 31.1 i obuhvata 25.910 parova baza.[5] Gen proizvodi protein od 63 kDa sa 557 aminokiselina.[9][10] Protein ima 12 pretpostavljenih transmembranskih domena, sa dugom vanćelijskom petljom od 107 aminokiselina, između prve dva transmembranska domena i unutarćelijskom petljom između četvrtog i petog transmembranskog domena. Ova duga vanćelijska petlja ima tri potencijalna mjesta za N-glikozilaciju, a unutarćelijska petlja ima ATP/GTP vezujući motiv. U pretpostavljenim unutarćelijskim domenima postoji pet potencijalnih mjesta za fosforilaciju ovisne o protein-kinazi C i jedno za fosforilaciju ovisnu o protein-kinazi A.[11]

Funkcija

Gen SLC22A5 kodira plazmatski integralni membranski protein koji funkcionira i kao transporter organskih kationa i transporter visokog afiniteta karnitina ovisnog o natriju.[5] Kodirani protein uključen je u aktivno ćelijsko preuzimanje karnitina, prenoseći jedan natrijev ion s jednom molekulom karnitina. Organski kationi koji se prenose ovim proteinom uključuju tetraetilamonij (TEA) bez uključivanja natrija. Odnos relativne aktivnosti preuzimanja karnitina i TEA je 11,3.[12]

Klinički značaj

Glavni fenotipski učinak autosomno recesivnih mutacija, bilo složena heterozigotna ili homozigotna,[6] u genu SLC22A5 je sistemski primarni nedostatak karnitina,[8] karakterizirana je smanjenim transportom karnitina, gubitkom karnitina u urinu, niskim koncentracijama karnitina u serumu, smanjenom unutarćelijskom akumulacijom karnitina, smanjenom beta-oksidacijom i citosolnim masnimm kiselinama.[6] Pacijenti često pokazuju metaboličku dekompenzaciju, hipoketonsku hipoglikemija, jetrenu encefalopatiju, Reyeov sindrom i iznenadnu smrt novorođenčadi u prvoj godini, nakon čega jeslijedi kasniji početak kardiomiopatija ili skeletnih miopatija, aritmije, slabost mišića i zatajenje srca u ranom djetinjstvu.[6][13][14]

Pacijenti mogu biti asimptomski, pri čemu oko 70% takvih pacijenata ima misens mutacije ili delecije; učestalost nonsens mutacija je povećana kod simptomskih pacijenata.[15] Simptomi i ishod bolesti mogu se drastično poboljšati zamjenskom terapijom, uzimanjem L-karnitina.[16] Procijenjena incidencija primarnog nedostatka karnitina u novorođenčadi je oko 1/40.000.[17]

Interakcije

SLC22A5 ima interakcije sa PDZK1.[12]

Također pogledajte

References

Dopunska literatura

Vanjski linkovi

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.