ヘテロ核リボ核タンパク質

hnRNPは特定の細胞周期を制御するタンパク質のリクルート、スプライシング、共調節によって、細胞周期のいくつかの面に影響を与える。細胞周期の制御におけるhnRNPの重要性は、その機能の喪失によってさまざまな一般的ながんが引き起こされることからも示される。多くの場合、hnRNPによる誤った調節は主にスプライシングのエラーによるものであるが、一部のhnRNPは新生RNA鎖に対する作用だけでなくタンパク質自身のリクルートやガイドも担っている。

hnRNP C（英語版）はBRCA1とBRCA2の主要な調節因子である。hnRNP Cは電離放射線照射に応答してDNA損傷部位に部分的に局在し、欠失した場合にはS期の進行に異常が生じる^[7]。さらに、hnRNP Cを喪失している場合にはBRCA1とBRCA2のレベルは低下する。BRCA1とBRCA2は重要ながん抑制遺伝子であり、その変異は乳がんに関与していることが強く示唆されている。特にBRCA1はCHEK1シグナル伝達カスケードを介してDNA損傷に応答し、G₂/M期での細胞周期の停止を引き起こす^[8]。hnRNP CはRAD51やBRIP1を含む他のがん抑制遺伝子の適切な発現にも重要である。hnRNPは、これらの遺伝子を介して行われる、電離放射線によるDNA損傷に応答した細胞周期の停止の誘導に必要である^[6]。

HER2は乳がんの20–30%で過剰発現しており、一般的に予後の悪さと関係している。HER2の異なるスプライスバリアントは異なる機能を持つことが示されている。hnRNP H1（英語版）のノックダウンは、発がん性バリアントであるΔ16HER2の量を増加させることが示されている^[9]。HER2はサイクリンD1とp27の上流の調節因子であり、過剰発現はG₁/S期チェックポイントの調節異常をもたらす^[10]。

hnRNPはp53と協調的なDNA損傷応答にも関与している。hnRNP Kは電離放射線によるDNA損傷後に迅速に誘導される。hnRNP Kはp53と協調的にp53標的遺伝子の活性化を誘導し、細胞周期チェックポイントを活性化する^[11]。p53自身は重要ながん抑制因子であり、"the guardian of the genome"という異名でも知られる。hnRNP Kとp53との密接な関係は、DNA損傷制御における重要性を示している。

p53は、lincRNA（large intergenic noncoding RNA）と呼ばれる、タンパク質に翻訳されない多くのRNAも調節している。p53の抑制はしばしばこうした多数のlincRNAによって行われ、hnRNP Kを介して作用することが示されている。hnRNP Kはこうした分子との物理的な相互作用によって、p53依存的な転写経路の重要な抑制因子として作用する^[12][13]。

hnRNPは次のような細胞内のさまざまな過程に関与している。

1. pre-mRNAが他のタンパク質との相互作用を妨げる可能性のある二次構造へフォールディングすることの防止
2. スプライシング装置との相互作用
3. mRNAの核外への輸送

pre-mRNAとhnRNPとの結合は相補的領域での塩基対形成による短い二次構造の形成を防ぎ、他のタンパク質がpre-mRNAにアクセスできるようにしている。

hnRNPはスプライシング機構を介して、細胞表面の糖タンパク質であるCD44を調節することが示されている。CD44は細胞間相互作用に関与し、細胞接着や遊走過程に機能している。CD44のスプライシングとその結果生じるアイソフォームは乳がんでは異なるものとなっており、hnRNP A1をノックダウンすることで細胞の生存と浸潤性の双方が低下する^[14]。

いくつかのhnRNPはテロメアと相互作用する。テロメアは染色体の末端を保護しており、細胞の寿命と関係していることが多い。hnRNP D（英語版）はテロメアのGリッチリピート領域と結合し、おそらくテロメアの増幅を阻害する二次構造を形成しないよう安定化している^[15]。

hnRNPはテロメラーゼとも相互作用することが示されている。テロメラーゼはテロメアを伸長し、分解を防いでいる。hnRNP C1/C2（英語版）はテロメラーゼRNA要素と結合し、テロメアへアクセスする能力を向上させている^[16][17][18]。

• メッセンジャーRNP（英語版） - 細胞核に存在するmRNAとタンパク質の複合体