マレー・ポリネシア語派

下位区分としては以下のように、フィリピン語群とインド・メラネシア語群に分けられる。（ただし分類については異説もある）

• フィリピン語群：台湾島嶼部のタオ族（ヤミ族）から南のフィリピンまでこの系統に入るとされる。イロカノ語、パンパンガ語、タガログ語、セブアノ語、ボホラノ語、ワライ語、ビコール語、ヒリガイノン語はフィリピン8大言語と呼ばれる^[1]。
  • 北部フィリピン諸語
    • バタン諸語（英語版）
      • タオ語 - タオ族
      • イヴァターヌン語 - イヴァタン族（英語版）
    • イロカノ語
    • パンパンガ語（カパンパンガン語）
  • 中央フィリピン諸語（英語版） (Greater Central Philippine languages)
    • タガログ語、フィリピン語（タガログ語を標準化したフィリピンの公用語）
    • セブアノ語、ボホラノ語（英語版）
    • ワライ語
    • ビコール語
    • ヒリガイノン語（イロンゴ語）
    • タウスグ語
  • カラミア諸語（英語版） (Calamian Tagbanwa) - Tagbanwa people
  • ミンダナオ諸語（英語版）（南部フィリピン諸語）
    • マギンダナオ語
    • マラナオ語
  • サンギリック語群（英語版）
  • ミナハサン語群（英語版）
• サマ・バジャウ語群（英語版） ※フィリピン諸語と同じグループに分類されることもある。
• インド・メラネシア語群（英語版）
  • ボルネオ語群（英語版）：ボルネオ島、スラウェシ島北部からマダガスカルなどの言語を含む。
    • サバ諸語（英語版）
    • バリト諸語（英語版）
      • 東バリト諸語（英語版）
        • マアニヤン語（英語版）：ボルネオ島南部
        • マダガスカル語（マラガシ語）
      • 西バリト諸語（英語版）
        • ガジュ語（英語版）：ボルネオ島南西部
      • マハカム諸語（英語版）
    • 北サラワク諸語（英語版）
  • 中核マレー・ポリネシア語群（英語版）：オーストロネシア語族最大のグループであり、海南島やスマトラ島からハワイ諸島、イースター島まで分布している。
    • スンダ・スラウェシ語群（英語版）（もしくは西マレー・ポリネシア語群）：上記以外のインドネシア中西部、ミクロネシア西部（チャモロ語、パラオ語など）。
      • マレー・スンバワ語群（英語版）
        • ジャワ語
        • スンダ語
        • マドゥラ語
        • アチェ・チャム諸語：インドシナ半島（チャム語）、アチェ語、回輝語
        • バリ・ササク諸語（英語版）：バリ語、ササク語
        • 北西スマトラ諸語（英語版）：バタク語、ニアス語、ガヨ語
        • マライック諸語（英語版）：マレー半島（インドネシア語、マレー語）、バンジャル語
      • 南スラウェシ諸語（英語版）
        • マカッサル語
        • ブギス語
      • セレベス諸語（英語版）
        • サルアン・バンガイ諸語（英語版）
        • カイリ・パモナ諸語（英語版）
        • ブンク・トラキ諸語（英語版）
        • ウォトゥ・ウォリオ諸語（英語版）
        • ムナ・ブトゥン諸語（英語版）：チアチア語、ムナ語（英語版）
      • パラオ語
      • チャモロ語
    • 中東部マレー・ポリネシア語群（英語版）：インドネシア東部（テトゥン語など）～大洋州
      • スンバ・フローレス諸語（英語版）
      • 中央マルク諸語（英語版）
      • ティモール・バベル諸語（英語版）
        • テトゥン語（東ティモールの公用語）、ベカイス語（英語版）
        • ウアブ・メト語（英語版）、ダワン語（英語版）
        • ウェタル語（英語版）、ガロリ語（英語版）
        • カワイミナ諸語（英語版）、マクヴァ語（英語版）（ロヴァイア語）
        • マンバイ語（英語版）
        • トコデデ語（英語版）、ケマク語（英語版）
        • イダラカ語（英語版）
      • 大洋州諸語（オセアニア諸語）：ニューギニア島の一部・メラネシア・ミクロネシア中東部・ポリネシア。
        • 西大洋州諸語（英語版）
          • 北部ニューギニア諸語（英語版）：アヌス語
          • Papuan Tip諸語（英語版）：モトゥ語（英語版）（モトゥ語を基にしたピジン言語ヒリモトゥ語はパプアニューギニアの公用語）
        • 中部メラネシア諸語（英語版）
          • クアヌア語（トライ語）
          • 南東ソロモン諸語（英語版）
        • アドミラルティ諸島諸語
        • ヤップ語
        • テモツ諸語（英語版）
          • リーフ諸島諸語（英語版）
          • ウトゥプア諸語（英語版）
          • バニコロ諸語（英語版）
        • 南大洋州諸語（英語版）
        • ミクロネシア諸語
          • ナウル語
          • キリバス語
          • 中核ミクロネシア諸語：マーシャル語、コスラエ語、チューク語、カロリン語、トビ語
        • 中央太平洋諸語（フィジー・ポリネシア諸語）
          • フィジー語
          • ポリネシア諸語
            • トンガ語
            • ニウエ語
            • 中核ポリネシア諸語（英語版）：サモア語、トケラウ語、ツバル語、タヒチ語、ペンリン語、ラロトンガ語、マオリ語、ハワイ語、ラパ・ヌイ語

• Glottolog - Malayo-Polynesian （英語）（マックス・プランク進化人類学研究所によるデータベース）