Коронавирусы (подсемейство)
Коро́навирусы[2] (лат. Orthocoronavirinae) — подсемейство вирусов из семейства Coronaviridae[3], объединяющее оболочечные РНК-содержащие плеоморфные[К 1] вирусы, вызывающие широкий спектр заболеваний различной тяжести у животных, включая человека[4]. В большинстве случаев коронавирусные инфекции протекают в лёгкой форме, однако в XXI веке происходили вспышки тяжёлых заболеваний, вызываемых бетакоронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV[4], а также SARS-CoV-2. Это вирусы с (+)одноцепочечной РНК-геном и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов варьируется от приблизительно 27 до 34 килобаз, самый большой среди известных РНК-вирусов.
| Коронавирусы | |
|---|---|
 Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARSCoV) | |
| Научная классификация | |
Реалм: Царство: Тип: Класс: Pisoniviricetes Порядок: Подпорядок: Cornidovirineae Семейство: Подсемейство: Коронавирусы | |
| Международное научное название | |
| Orthocoronavirinae | |
| Синонимы | |
| |
| Группа по Балтимору | |
| IV: (+)оцРНК-вирусы | |
Геном
Коронавирусы содержат геном с одноцепочечной смысловой РНК. Размер их генома колеблется от 27 до 34 килобаз является одним из самых больших среди РНК-вирусов. Геном имеет 5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост. Геномная организация коронавируса: 5'-НТО лидерная последовательность — репликаза / транскриптаза — шип (S) — оболочка (E) — нуклеокапсид (N) — 3’НТО — поли(A) хвост. Открытые рамки считывания 1a и 1b, которые занимают первые две трети генома, кодируют полипротеин репликазы / транскриптазы. Полипротеины репликазы / транскриптазы саморасщепляется, образуя неструктурные белки (nsps). Далее идут рамки считывания, кодирующие четыре основных структурных белка: шип, оболочку, мембрану и нуклеокапсид. Перемежаясь с этими рамками расположены рамки считывания для вспомогательных белков. Количество вспомогательных белков и их функция различны для разных коронавирусов.
Жизненный цикл
Зарождение
Инфекция начинается, когда вирусный шип (S) гликопротеин прикрепляется к своему комплементарному рецептору клетки-хозяина. После прикрепления протеаза клетки-хозяина расщепляется и активирует прикрепленный к рецептору спайковый белок. В зависимости от доступной протеазы клетки-хозяина, расщепление и активация позволяют клетке проникать посредством эндоцитоза или прямого слияния вирусной оболочки с мембраной хозяина. При проникновении в клетку-хозяина вирусная частица не имеет покрытия и ее геном попадает в цитоплазму клетки. Геном РНК коронавируса имеет 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост, что позволяет РНК прикрепляться к рибосоме клетки-хозяина для трансляции. Рибосома хозяина транслирует исходную перекрывающуюся открытую рамку считывания генома вируса и образует длинный полипротеин. Полипротеин имеет свои собственные протеазы, которые расщепляют полипротеин на множество неструктурных белков.
Классификация
До 2009 года представителей подсемейства объединяли в род Coronavirus[5], но в 2009 году систематику коронавирусов пересмотрели: Coronavirus разделили на 3 рода (Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus), объединённых в подсемейство Coronavirinae[6].
Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) по состоянию на апрель 2020 года выделяет в подсемействе 4 рода[7]:
- Род Alphacoronavirus (14 подродов и 19 видов)
- Род Betacoronavirus (5 подродов и 14 видов)
- Род Gammacoronavirus (3 подрода и 5 видов)
- Род Deltacoronavirus (3 подрода и 7 видов)
Примечания
- Комментарии
- Источники