Orthocoronavirinae

Bis heute (Stand 2020) entspricht die Beschreibung der Unterfamilie Orthocoronavirinae nahezu vollständig der der übergeordneten Familie Coronaviridae. Das liegt daran, dass die einzige Schwestergruppe – die Unterfamilie der Letoviren (Letovirinae) – nur wenig erforscht ist und nur eine einzige Art – Microhyla letovirus 1 – enthält. Neben strukturellen und statistischen Unterschieden im Virusgenom bei computergestützten Analysen (vgl. Bioinformatik) besteht der wesentlichste Unterschied zwischen den beiden Unterfamilien Orthocoronavirinae und Letovirinae vor allem darin, dass die Letoviren die ersten Coronaviren sind, die Amphibien infizieren.^[2][3]

Etymologie

Der Name der Unterfamilie Orthocoronavirinae setzt sich aus dem Vorsatz „Ortho-“ (griechisch ὀρθός orthós, deutsch ‚recht, richtig, aufrecht‘) und dem früheren Namen dieser Unterfamilie Coronavirinae zusammen. „Orthocoronaviren“ bedeutet soviel wie: „richtige, eigentliche, klassische oder echte Coronaviren“. Das entspricht der zuvor gebrauchten umgangssprachlichen Bezeichnung: „echte Coronaviren“ (englisch true coronaviruses^[4]), für die Viren dieser Gruppe, bevor die Gruppe den jetzigen Namen erhielt.

Diese Virengruppe wurde zunächst als Gattung unter dem Namen Coronavirus geführt (bis 2008). Durch den Aufstieg in den Rang einer Unterfamilie wurde die Endung in „-virinae“ geändert.^[4] Die Herkunft des Namensbestandteils „corona“ wird genauer im Abschnitt Etymologie im Artikel zur Familie Coronaviridae erläutert.

Die Namenserweiterung „Ortho-“ beendete 2018 gewisse Mehrdeutigkeiten, die innerhalb der Familie Coronaviridae aufgrund dessen bestanden, dass der gleiche Wortstamm „Corona-“ für mehrere ineinanderliegende Gruppen verwendet worden war.^[5] Näheres unter Taxonomische Hintergründe.

Verwendete Namen

Aus dem Taxonnamen Orthocoronavirinae ergibt sich systematisch die Sammelbezeichnung (englisch collective name^[6]) „Orthocoronaviren“ für Viren dieser Unterfamilie.^[7][8] Besonders im Englischen wird diese Art der Sammelbezeichnung auch „Vernakularname“ (englisch vernacular name) genannt.^[5]

Die Sammelbezeichnung „Orthocoronaviren“ ist noch verhältnismäßig jung im Vergleich zum seit den 1960er Jahren gebrauchten Namen „Coronaviren“.^[9] Obwohl der ältere Name „Coronaviren“ zweideutig sowohl die Viren der ganzen Familie^[10] als auch nur der Unterfamilie (früher: Gattung^[4]) bezeichnet, ist er weiter auch für nur die Viren der Unterfamilie im Gebrauch.^{[11][12][13][14][15]}

Aus diesen Gründen existieren grundsätzlich immer noch zwei Vernakularnamen für die Viren dieser Gruppe. Einmal der doppeldeutige Name „Coronaviren“ (englisch coronaviruses). Dieser findet sich in Literatur bis 2018^[16] und häufig auch noch nach 2018. Und dann der eindeutige Name „Orthocoronaviren“ als taxonomische Sammelbezeichnung seit 2018. Der eigentlich korrekte und eindeutige englische Vernakularname "coronavirids" findet allerdings auch heute noch nur gelegentlich Verwendung,^[17] dieser ist analog der Bezeichnung nanovirids des ICTV^[18] für die Familie Nanoviridae, sowie hominids bzw. camelids^[19] für die Familien der Hominiden respektive Cameliden gebildet.^{[Anm. 1]}

Wegen der Namensähnlichkeit zwischen Familie und Unterfamilie kommt es allenthalben auch zur Falschschreibung des Unterfamiliennamens in der Form: Orthocoronaviridae.^[20]

Äußere Systematik

Die Unterfamilie Orthocoronavirinae besitzt aktuell nur eine Schwester-Unterfamilie in der Familie Coronaviridae. Diese heißt Letovirinae und ersetzte 2018 die damalige Schwester-Unterfamilie Torovirinae (heute Familie Tobaniviridae mit der neuen(!) Unterfamilie Torovirinae).^[2]

Familie	Unterfamilie
Coronaviridae
	Letovirinae
	Orthocoronavirinae

Innere Systematik

Auszug aus der systematischen Darstellung nach ICTV. Eine ausführlichere Darstellung findet sich im Artikel über die Familie Coronaviridae im Abschnitt über die innere Systematik.

Unterfamilie Orthocoronavirinae

Gattung Alphacoronavirus

Untergattung Colacovirus

Spezies Bat coronavirus CDPHE15

Untergattung Decacovirus

Spezies Bat coronavirus HKU10

Spezies Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013

Untergattung Duvinacovirus

Spezies Human coronavirus 229E

Untergattung Luchacovirus

Spezies Lucheng Rn rat coronavirus

Untergattung Minacovirus

Spezies Mink coronavirus 1

Untergattung Minunacovirus

Spezies Miniopterus bat coronavirus 1

Spezies Miniopterus bat coronavirus HKU8

Untergattung Myotacovirus

Spezies Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011

Untergattung Nyctacovirus

Spezies Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013

Spezies Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398

Untergattung Pedacovirus

Spezies Porcine epidemic diarrhea virus

Spezies Scotophilus bat coronavirus 512

Untergattung Rhinacovirus

Spezies Rhinolophus bat coronavirus HKU2 (mit Stamm Enterisches Schweine-Alphacoronavirus, SADS-CoV)

Untergattung Setracovirus

Spezies Human coronavirus NL63

Spezies NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b

Untergattung Soracovirus

Spezies Sorex araneus coronavirus T14

Untergattung Sunacovirus

Spezies Suncus murinus coronavirus X74

Untergattung Tegacovirus

Spezies Alphacoronavirus 1 (*)

Gattung Betacoronavirus

Untergattung Embecovirus

Spezies Betacoronavirus 1 (mit Stamm Humanes Coronavirus OC43)

Spezies China Rattus coronavirus HKU24

Spezies Human coronavirus HKU1

Spezies Murine coronavirus (*)

Spezies Myodes coronavirus 2JL14

Untergattung Hibecovirus

Spezies Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

Untergattung Merbecovirus

Spezies Hedgehog coronavirus 1

Spezies Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

Spezies Pipistrellus bat coronavirus HKU5

Spezies Tylonycteris bat coronavirus HKU4

Untergattung Nobecovirus

Spezies Eidolon bat coronavirus C704

Spezies Rousettus bat coronavirus GCCDC1

Spezies Rousettus bat coronavirus HKU9

Untergattung Sarbecovirus

Spezies Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (mit SARS-CoV-2)

Gattung Gammacoronavirus

Untergattung Brangacovirus

Spezies Goose coronavirus CB17

Untergattung Cegacovirus

Spezies Beluga whale coronavirus SW1

Untergattung Igacovirus

Spezies Avian coronavirus (*, mit Stamm Infectious bronchitis virus, IBV)

Spezies Avian coronavirus 9203

Spezies Duck coronavirus 2714

Gattung Deltacoronavirus

Untergattung Andecovirus

Spezies Wigeon coronavirus HKU20

Untergattung Buldecovirus

Spezies Bulbul coronavirus HKU11 (*)

Spezies Common moorhen coronavirus HKU21

Spezies Coronavirus HKU15

Spezies Munia coronavirus HKU13

Spezies White-eye coronavirus HKU16

Untergattung Herdecovirus

Spezies Night heron coronavirus HKU19

Taxonomische Hintergründe

Die taxonomische Benennung und Einordnung der Orthocoronaviren fand immer vor dem Hintergrund der taxonomischen Gesamtorganisation der Virenfamilie Coronaviridae statt und kann dort nachgelesen werden.